COL23A1

COL23A1
Ідентифікатори
Символи	COL23A1, collagen type XXIII alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 610043 MGI: 2653243 HomoloGene: 72101 GeneCards: COL23A1
Пов'язані генетичні захворювання
	нервова булімія, ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • extracellular matrix structural constituent; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • мембрана; • міжклітинний простір; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• Ангіогенез; • endothelial cell morphogenesis; • extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	91522
	237759
	ENSG00000050767
	ENSMUSG00000063564
	Q86Y22
	Q8K4G2
	NM_173465
	NM_153393
	NP_775736
	NP_700442
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL23A1 (англ. Collagen type XXIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 51 944^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPGERAGGG	GDAGKGNAAG	GGGGGRSATT	AGSRAVSALC	LLLSVGSAAA
CLLLGVQAAA	LQGRVAALEE	ERELLRRAGP	PGALDAWAEP	HLERLLREKL
DGLAKIRTAR	EAPSECVCPP	GPPGRRGKPG	RRGDPGPPGQ	SGRDGYPGPL
GLDGKPGLPG	PKGEKGAPGD	FGPRGDQGQD	GAAGPPGPPG	PPGARGPPGD
TGKDGPRGAQ	GPAGPKGEPG	QDGEMGPKGP	PGPKGEPGVP	GKKGDDGTPS
QPGPPGPKGE	PGSMGPRGEN	GVDGAPGPKG	EPGHRGTDGA	AGPRGAPGLK
GEQGDTVVID	YDGRILDALK	GPPGPQGPPG	PPGIPGAKGE	LGLPGAPGID
GEKGPKGQKG	DPGEPGPAGL	KGEAGEMGLS	GLPGADGLKG	EKGESASDSL
QESLAQLIVE	PGPPGPPGPP	GPMGLQGIQG	PKGLDGAKGE	KGASGERGPS
GLPGPVGPPG	LIGLPGTKGE	KGRPGEPGLD	GFPGPRGEKG	DRSERGEKGE
RGVPGRKGVK	GQKGEPGPPG	LDQPCPVGPD	GLPVPGCWHK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Banyard J., Bao L., Zetter B.R. (2003). Type XXIII collagen, a new transmembrane collagen identified in metastatic tumor cells. J. Biol. Chem. 278: 20989—20994. PMID 12644459 DOI:10.1074/jbc.M210616200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504