COL22A1

COL22A1 (англ. Collagen type XXII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 626 амінокислот, а молекулярна маса — 161 145.

COL22A1
Ідентифікатори
Символи	COL22A1, collagen, type XXII, alpha 1, collagen type XXII alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 610026 MGI: 1916950 HomoloGene: 43567 GeneCards: COL22A1
Пов'язані генетичні захворювання
бронхіальна астма
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	169044	69700
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000079022
UniProt	Q8NFW1	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_152888	NM_027174
RefSeq (білок)	NP_690848	н/д
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 15: 71.67 – 71.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGLRGNAVA		GLLWMLLLWS		GGGGCQAQRA		GCKSVHYDLV		FLLDTSSSVG
KEDFEKVRQW		VANLVDTFEV		GPDRTRVGVV		RYSDRPTTAF		ELGLFGSQEE
VKAAARRLAY		HGGNTNTGDA		LRYITARSFS		PHAGGRPRDR		AYKQVAILLT
DGRSQDLVLD		AAAAAHRAGI		RIFAVGVGEA		LKEELEEIAS		EPKSAHVFHV
SDFNAIDKIR		GKLRRRLCEN		VLCPSVRVEG		DRFKHTNGGT		KEITGFDLMD
LFSVKEILGK		RENGAQSSYV		RMGSFPVVQS		TEDVFPQGLP		DEYAFVTTFR
FRKTSRKEDW		YIWQVIDQYS		IPQVSIRLDG		ENKAVEYNAV		GAMKDAVRVV
FRGSRVNDLF		DRDWHKMALS		IQAQNVSLHI		DCALVQTLPI		EERENIDIQG
KTVIGKRLYD		SVPIDFDLQR		IVIYCDSRHA		ELETCCDIPS		GPCQVTVVTE
PPPPPPPQRP		PTPGSEQIGF		LKTINCSCPA		GEKGEMGVAG		PMGLPGPKGD
IGAIGPVGAP		GPKGEKGDVG		IGPFGQGEKG		EKGSLGLPGP		PGRDGSKGMR
GEPGELGEPG		LPGEVGMRGP		QGPPGLPGPP		GRVGAPGLQG		ERGEKGTRGE
KGERGLDGFP		GKPGDTGQQG		RPGPSGVAGP		QGEKGDVGPA		GPPGVPGSVV
QQEGLKGEQG		APGPRGHQGA		PGPPGARGPI		GPEGRDGPPG		LQGLRGKKGD
MGPPGIPGLL		GLQGPPGPPG		VPGPPGPGGS		PGLPGEIGFP		GKPGPPGPTG
PPGKDGPNGP		PGPPGTKGEP		GERGEDGLPG		KPGLRGEIGE		QGLAGRPGEK
GEAGLPGAPG		FPGVRGEKGD		QGEKGELGLP		GLKGDRGEKG		EAGPAGPPGL
PGTTSLFTPH		PRMPGEQGPK		GEKGDPGLPG		EPGLQGRPGE		LGPQGPTGPP
GAKGQEGAHG		APGAAGNPGA		PGHVGAPGPS		GPPGSVGAPG		LRGTPGKDGE
RGEKGAAGEE		GSPGPVGPRG		DPGAPGLPGP		PGKGKDGEPG		LRGSPGLPGP
LGTKAACGKV		RGSENCALGG		QCVKGDRGAP		GIPGSPGSRG		DPGIGVAGPP
GPSGPPGDKG		SPGSRGLPGF		PGPQGPAGRD		GAPGNPGERG		PPGKPGLSSL
LSPGDINLLA		KDVCNDCPPG		PPGLPGLPGF		KGDKGVPGKP		GREGTEGKKG
EAGPPGLPGP		PGIAGPQGSQ		GERGADGEVG		QKGDQGHPGV		PGFMGPPGNP
GPPGADGIAG		AAGPPGIQGS		PGKEGPPGPQ		GPSGLPGIPG		EEGKEGRDGK
PGPPGEPGKA		GEPGLPGPEG		ARGPPGFKGH		TGDSGAPGPR		GESGAMGLPG
QEGLPGKDGD		TGPTGPQGPQ		GPRGPPGKNG		SPGSPGEPGP		SGTPGQKGSK
GENGSPGLPG		FLGPRGPPGE		PGEKGVPGKE		GVPGKPGEPG		FKGERGDPGI
KGDKGPPGGK		GQPGDPGIPG		HKGHTGLMGP		QGLPGENGPV		GPPGPPGQPG
FPGLRGESPS		METLRRLIQE		ELGKQLETRL		AYLLAQMPPA		YMKSSQGRPG
PPGPPGKDGL		PGRAGPMGEP		GRPGQGGLEG		PSGPIGPKGE		RGAKGDPGAP
GVGLRGEMGP		PGIPGQPGEP		GYAKDGLPGI		PGPQGETGPA		GHPGLPGPPG
PPGQCDPSQC		AYFASLAARP		GNVKGP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8