COL21A1
білок людини
COL21A1 (англ. Collagen type XXI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 957 амінокислот, а молекулярна маса — 99 369[4].
| COL21A1 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | COL21A1, collagen, type XXI, alpha 1, COLA1L, dJ682J15.1, dJ708F5.1, FP633, collagen type XXI alpha 1, collagen type XXI alpha 1 chain | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 610002 HomoloGene: 49949 GeneCards: COL21A1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
|
|||||||||||||||
| Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
| UniProt |
|
|
|||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 6: 56.06 – 56.39 Mb | н/д | |||||||||||||||
| PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAHYITFLCM | VLVLLLQNSV | LAEDGEVRSS | CRTAPTDLVF | ILDGSYSVGP | ||||
| ENFEIVKKWL | VNITKNFDIG | PKFIQVGVVQ | YSDYPVLEIP | LGSYDSGEHL | ||||
| TAAVESILYL | GGNTKTGKAI | QFALDYLFAK | SSRFLTKIAV | VLTDGKSQDD | ||||
| VKDAAQAARD | SKITLFAIGV | GSETEDAELR | AIANKPSSTY | VFYVEDYIAI | ||||
| SKIREVMKQK | LCEESVCPTR | IPVAARDERG | FDILLGLDVN | KKVKKRIQLS | ||||
| PKKIKGYEVT | SKVDLSELTS | NVFPEGLPPS | YVFVSTQRFK | VKKIWDLWRI | ||||
| LTIDGRPQIA | VTLNGVDKIL | LFTTTSVING | SQVVTFANPQ | VKTLFDEGWH | ||||
| QIRLLVTEQD | VTLYIDDQQI | ENKPLHPVLG | ILINGQTQIG | KYSGKEETVQ | ||||
| FDVQKLRIYC | DPEQNNRETA | CEIPGFNGEC | LNGPSDVGST | PAPCICPPGK | ||||
| PGLQGPKGDP | GLPGNPGYPG | QPGQDGKPGY | QGIAGTPGVP | GSPGIQGARG | ||||
| LPGYKGEPGR | DGDKGDRGLP | GFPGLHGMPG | SKGEMGAKGD | KGSPGFYGKK | ||||
| GAKGEKGNAG | FPGLPGPAGE | PGRHGKDGLM | GSPGFKGEAG | SPGAPGQDGT | ||||
| RGEPGIPGFP | GNRGLMGQKG | EIGPPGQQGK | KGAPGMPGLM | GSNGSPGQPG | ||||
| TPGSKGSKGE | PGIQGMPGAS | GLKGEPGATG | SPGEPGYMGL | PGIQGKKGDK | ||||
| GNQGEKGIQG | QKGENGRQGI | PGQQGIQGHH | GAKGERGEKG | EPGVRGAIGS | ||||
| KGESGVDGLM | GPAGPKGQPG | DPGPQGPPGL | DGKPGREFSE | QFIRQVCTDV | ||||
| IRAQLPVLLQ | SGRIRNCDHC | LSQHGSPGIP | GPPGPIGPEG | PRGLPGLPGR | ||||
| DGVPGLVGVP | GRPGVRGLKG | LPGRNGEKGS | QGFGYPGEQG | PPGPPGPEGP | ||||
| PGISKEGPPG | DPGLPGKDGD | HGKPGIQGQP | GPPGICDPSL | CFSVIARRDP | ||||
| FRKGPNY |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
ред.- Fitzgerald J., Bateman J.F. (2001). A new FACIT of the collagen family: COL21A1. FEBS Lett. 505: 275—280. PMID 11566190 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02754-5
- Chou M.-Y., Li H.-C. (2002). Genomic organization and characterization of the human type XXI collagen (COL21A1) gene. Genomics. 79: 395—401. PMID 11863369 DOI:10.1006/geno.2002.6712
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17025 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
- ↑ UniProt, Q96P44 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
ред.
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |