COL20A1

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

COL20A1 (англ. Collagen type XX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 284 амінокислот, а молекулярна маса — 135 830[4].

COL20A1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL20A1, bA261N11.4, collagen type XX alpha 1, collagen type XX alpha 1 chain
Зовнішні ІД MGI: 1920618 HomoloGene: 75138 GeneCards: COL20A1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_020882
NM_028518
RefSeq (білок)
NP_065933
NP_082794
Локус (UCSC) Хр. 20: 63.29 – 63.33 Mb Хр. 2: 180.63 – 180.66 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSSGDPAHLGLCLWLWLGATLGREQVQASGLLRLAVLPEDRLQMKWRESE
GSGLGYLVQVKPMAGDSEQEVILTTKTPKATVGGLSPSKGYTLQIFELTG
SGRFLLARREFVIEDLKSSSLDRSSQRPLGSGAPEPTPSHTGSPDPEQAS
EPQVAFTPSQDPRTPAGPQFRCLPPVPADMVFLVDGSWSIGHSHFQQVKD
FLASVIAPFEIGPDKVQVGLTQYSGDAQTEWDLNSLSTKEQVLAAVRRLR
YKGGNTFTGLALTHVLGQNLQPAAGLRPEAAKVVILVTDGKSQDDVHTAA
RVLKDLGVNVFAVGVKNADEAELRLLASPPRDITVHSVLDFLQLGALAGL
LSRLICQRLQGGSPRQGPAAAPALDTLPAPTSLVLSQVTSSSIRLSWTPA
PRHPLKYLIVWRASRGGTPREVVVEGPAASTELHNLASRTEYLVSVFPIY
EGGVGEGLRGLVTTAPLPPPRALTLAAVTPRTVHLTWQPSAGATHYLVRC
SPASPKGEEEEREVQVGRPEVLLDGLEPGRDYEVSVQSLRGPEGSEARGI
RARTPTLAPPRHLGFSDVSHDAARVFWEGAPRPVRLVRVTYVSSEGGHSG
QTEAPGNATSATLGPLSSSTTYTVRVTCLYPGGGSSTLTGRVTTKKAPSP
SQLSMTELPGDAVQLAWVAAAPSGVLVYQITWTPLGEGKAHEISVPGNLG
TAVLPGLGRHTEYDVTILAYYRDGARSDPVSLRYTPSTVSRSPPSNLALA
SETPDSLQVSWTPPLGRVLHYWLTYAPASGLGPEKSVSVPGARSHVTLPD
LQAATKYRVLVSAIYAAGRSEAVSATGQTACPALRPDGSLPGFDLMVAFS
LVEKAYASIRGVAMEPSAFGGTPTFTLFKDAQLTRRVSDVYPAPLPPEHT
IVFLVRLLPETPREAFALWQMTAEDFQPLLGVLLDAGKKSLTYFHRDPRA
ALQEATFDPQEVRKIFFGSFHKVHVAVGRSKVRLYVDCRKVAERPLGEMG
SPPAAGFVTLGRLAKARGPRSSSAAFQLQMLQIVCSDTWADEDRCCELPA
SRDGETCPAFVSACSCSSETPGPPGPQGPPGLPGRNGTPGEQGFPGPRGP
PGVKGEKGDHGLPGLQGHPGHQGIPGRVGLQGPKGMRGLEGTAGLPGPPG
PRGFQGMAGARGTSGERGPPGTVGPTGLPGPKGERGEKGEPQSLATLYQL
VSQASHVSKFDSFHENTRPPMPILEQKLEPGTEPLGSPGTRSKALVPGEW
GRGGRHLEGRGEPGAVGQMGSPGQQGASTQGLWE

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

ред.
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143

Примітки

ред.
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14670 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 21 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9P218 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

ред.