CNTN5
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
CNTN5 (англ. Contactin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 100 амінокислот, а молекулярна маса — 120 686[5].
CNTN5 | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||
Символи | CNTN5, HNB-2s, NB-2, contactin 5 | ||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 607219 MGI: 3042287 HomoloGene: 28447 GeneCards: CNTN5 | ||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||
короткозорість, натуральна віспа[1] | |||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 11: 99.02 – 100.36 Mb | Хр. 9: 9.66 – 10.9 Mb | |||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASSWKLMLF | LSVTMCLSEY | SKSLPGLSTS | YAALLRIKKS | SSSSLFGSKT | ||||
RPRYSSPSLG | TLSASSPSWL | GAAQNYYSPI | NLYHSSDAFK | QDESVDYGPV | ||||
FVQEPDDIIF | PTDSDEKKVA | LNCEVRGNPV | PSYRWLRNGT | EIDLESDYRY | ||||
SLIDGTFIIS | NPSEAKDSGH | YQCLATNTVG | SILSREATLQ | FAYLGNFSGR | ||||
TRSAVSVREG | QGVVLMCSPP | PHSPEIIYSW | VFNEFPSFVA | EDSRRFISQE | ||||
TGNLYISKVQ | TSDVGSYICL | VKNTVTNARV | LSPPTPLTLR | NDGVMGEYEP | ||||
KIEVHFPFTV | TAAKGTTVKM | ECFALGNPVP | TITWMKVNGY | IPSKARLRKS | ||||
QAVLEIPNVQ | LDDAGIYECR | AENSRGKNSF | RGQLQVYTYP | HWVEKLNDTQ | ||||
LDSGSPLRWE | CKATGKPRPT | YRWLKNGVPL | SPQSRVEMVN | GVLMIHNVNQ | ||||
SDAGMYQCLA | ENKYGAIYAS | AELKILASAP | TFALNQLKKT | IIVTKDQEVV | ||||
IECKPQGSPK | PTISWKKGDR | AVRENKRIAI | LPDGSLRILN | ASKSDEGKYV | ||||
CRGENVFGSA | EIIASLSVKE | PTRIELTPKR | TELTVGESIV | LNCKAIHDAS | ||||
LDVTFYWTLK | GQPIDFEEEG | GHFESIRAQA | SSADLMIRNI | LLMHAGRYGC | ||||
RVQTTADSVS | DEAELLVRGP | PGPPGIVIVE | EITESTATLS | WSPAADNHSP | ||||
ISSYNLQARS | PFSLGWQTVK | TVPEIITGDM | ESAMAVDLNP | WVEYEFRVVA | ||||
TNPIGTGDPS | TPSRMIRTNE | AVPKTAPTNV | SGRSGRRHEL | VIAWEPVSEE | ||||
FQNGEGFGYI | VAFRPNGTRG | WKEKMVTSSE | ASKFIYRDES | VPPLTPFEVK | ||||
VGVYNNKGDG | PFSQIVVICS | AEGEPSAAPT | DVKATSVSVS | EILVAWKHIK | ||||
ESLGRPQGFE | VGYWKDMEQE | DTAETVKTRG | NESFVILTGL | EGNTLYHFTV | ||||
RAYNGAGYGP | PSSEVSATTK | KSPPSQAPSN | LRWEQQGSQV | SLGWEPVIPL | ||||
ANESEVVGYK | VFYRQEGHSN | SQVIETQKLQ | AVVPLPDAGV | YIIEVRAYSE | ||||
GGDGTASSQI | RVPSYSGGKI | TSAQSTLHSL | STSSSSVTLL | LALMIPSTSW | ||||
Кодований геном білок за функцією належить до ліпопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bouyain S., Watkins D.J. (2010). The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2443—2448. PMID 20133774 DOI:10.1073/pnas.0911235107
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CNTN5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2175 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O94779 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |