CNOT7

CNOT7 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 285 амінокислот, а молекулярна маса — 32 745.

CNOT7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D5R, 4GMJ
Ідентифікатори
Символи	CNOT7, CAF1, Caf1a, hCAF-1, CAF-1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7
Зовнішні ІД	OMIM: 604913 MGI: 1298230 HomoloGene: 49011 GeneCards: CNOT7
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • nucleic acid binding • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3'-5'-exoribonuclease activity • signal transducer activity • poly(A)-specific ribonuclease activity • exonuclease activity • RNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • transcription factor binding • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • мембрана • ядерні тільця • P-body • цитоплазма • nuclear speck • CCR4-NOT core complex • host cell PML body Біологічний процес • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of gene expression • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • P-body assembly • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mRNA catabolic process • gene silencing by miRNA • regulation of translation • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • GO:0072468 сигнальна трансдукція • Сайленсинг генів • transcription, DNA-templated • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of viral genome replication • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • carbohydrate metabolic process • negative regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29883	18983
Ensembl	ENSG00000198791	ENSMUSG00000031601
UniProt	Q9UIV1	Q60809
RefSeq (мРНК)	NM_013354 NM_054026 NM_001322087 NM_001322088 NM_001322089 NM_001322090 NM_001322091 NM_001322092 NM_001322093 NM_001322094 NM_001322095 NM_001322096 NM_001322097 NM_001322098 NM_001322099 NM_001322100	NM_001271542 NM_001271543 NM_011135 NM_001361938 NM_001361939
RefSeq (білок)	NP_001309016 NP_001309017 NP_001309018 NP_001309019 NP_001309020 NP_001309021 NP_001309022 NP_001309023 NP_001309024 NP_001309025 NP_001309026 NP_001309027 NP_001309028 NP_001309029 NP_037486 NP_473367	NP_001258471 NP_001258472 NP_035265 NP_001348867 NP_001348868
Локус (UCSC)	Хр. 8: 17.22 – 17.25 Mb	Хр. 8: 40.95 – 40.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAATVDHSQ		RICEVWACNL		DEEMKKIRQV		IRKYNYVAMD		TEFPGVVARP
IGEFRSNADY		QYQLLRCNVD		LLKIIQLGLT		FMNEQGEYPP		GTSTWQFNFK
FNLTEDMYAQ		DSIELLTTSG		IQFKKHEEEG		IETQYFAELL		MTSGVVLCEG
VKWLSFHSGY		DFGYLIKILT		NSNLPEEELD		FFEILRLFFP		VIYDVKYLMK
SCKNLKGGLQ		EVAEQLELER		IGPQHQAGSD		SLLTGMAFFK		MREMFFEDHI
DDAKYCGHLY		GLGSGSSYVQ		NGTGNAYEEE		ANKQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bianchin C., Mauxion F., Sentis S., Seraphin B., Corbo L. (2005). Conservation of the deadenylase activity of proteins of the Caf1 family in human. RNA. 11: 487—494. PMID 15769875 DOI:10.1261/rna.7135305
• Aslam A., Mittal S., Koch F., Andrau J.C., Winkler G.S. (2009). The Ccr4-NOT deadenylase subunits CNOT7 and CNOT8 have overlapping roles and modulate cell proliferation. Mol. Biol. Cell. 20: 3840—3850. PMID 19605561 DOI:10.1091/mbc.E09-02-0146
• Cooke A., Prigge A., Wickens M. (2010). Translational repression by deadenylases. J. Biol. Chem. 285: 28506—28513. PMID 20634287 DOI:10.1074/jbc.M110.150763
• Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
• Doidge R., Mittal S., Aslam A., Winkler G.S. (2012). The anti-proliferative activity of BTG/TOB proteins is mediated via the Caf1a (CNOT7) and Caf1b (CNOT8) deadenylase subunits of the Ccr4-not complex. PLoS ONE. 7: E51331—E51331. PMID 23236473 DOI:10.1371/journal.pone.0051331

Див. також

• Хромосома 8