CNOT6

CNOT6 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 63 307.

CNOT6
Ідентифікатори
Символи	CNOT6, CCR4, Ccr4a, CCR4-NOT transcription complex subunit 6
Зовнішні ІД	OMIM: 608951 MGI: 2144529 HomoloGene: 69187 GeneCards: CNOT6
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(A)-specific ribonuclease activity • exoribonuclease activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • 3'-5'-exoribonuclease activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • CCR4-NOT complex • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • transcription, DNA-templated • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly • gene silencing by miRNA • positive regulation of cell population proliferation • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • Сайленсинг генів • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay • regulation of translation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57472	104625
Ensembl	ENSG00000113300	ENSMUSG00000020362
UniProt	Q9ULM6	Q8K3P5
RefSeq (мРНК)	NM_001303241 NM_015455 NM_001370472 NM_001370473 NM_001370474	NM_001290741 NM_212484 NM_001363356 NM_001363357
RefSeq (білок)	NP_001290170 NP_001357401 NP_001357402 NP_001357403	NP_001277670 NP_997649 NP_001350285 NP_001350286
Локус (UCSC)	Хр. 5: 180.49 – 180.58 Mb	Хр. 11: 49.56 – 49.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKEKYEPPD		PRRMYTIMSS		EEAANGKKSH		WAELEISGKV		RSLSASLWSL
THLTALHLSD		NSLSRIPSDI		AKLHNLVYLD		LSSNKIRSLP		AELGNMVSLR
ELHLNNNLLR		VLPFELGKLF		QLQTLGLKGN		PLTQDILNLY		QEPDGTRRLL
NYLLDNLSGT		AKRITTEQPP		PRSWIMLQEP		DRTRPTALFS		VMCYNVLCDK
YATRQLYGYC		PSWALNWDYR		KKAIIQEILS		CNADIVSLQE		VETEQYYSFF
LVELKERGYN		GFFSPKSRAR		TMSEQERKHV		DGCAIFFKTE		KFTLVQKHTV
EFNQLAMANS		EGSEAMLNRV		MTKDNIGVAV		LLELRKESIE		MPSGKPHLGT
EKQLILVANA		HMHWDPEYSD		VKLVQTMMFL		SEVKNIIDKA		SRNLKSSVLG
EFGTIPLVLC		ADLNSLPDSG		VVEYLSTGGV		ETNHKDFKEL		RYNESLTNFS
CHGKNGTTNG		RITHGFKLQS		AYESGLMPYT		NYTFDFKGII		DYIFYSKPQL
NTLGILGPLD		HHWLVENNIS		GCPHPLIPSD		HFSLFAQLEL		LLPFLPQVNG
IHLPGRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen J., Chiang Y.-C., Denis C.L. (2002). CCR4, a 3'-5' poly(A) RNA and ssDNA exonuclease, is the catalytic component of the cytoplasmic deadenylase. EMBO J. 21: 1414—1426. PMID 11889047 DOI:10.1093/emboj/21.6.1414
• Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1. Genes Dev. 19: 351—361. PMID 15687258 DOI:10.1101/gad.1282305
• Garapaty S., Mahajan M.A., Samuels H.H. (2008). Components of the CCR4-NOT complex function as nuclear hormone receptor coactivators via association with the NRC-interacting Factor NIF-1. J. Biol. Chem. 283: 6806—6816. PMID 18180299 DOI:10.1074/jbc.M706986200
• Piao X., Zhang X., Wu L., Belasco J.G. (2010). CCR4-NOT deadenylates mRNA associated with complexes in human cells. Mol. Cell. Biol. 30: 1486—1494. PMID 20065043 DOI:10.1128/MCB.01481-09
• Mittal S., Aslam A., Doidge R., Medica R., Winkler G.S. (2011). The Ccr4a (CNOT6) and Ccr4b (CNOT6L) deadenylase subunits of the human Ccr4-Not complex contribute to the prevention of cell death and senescence. Mol. Biol. Cell. 22: 748—758. PMID 21233283 DOI:10.1091/mbc.E10-11-0898

Див. також

• Хромосома 5