CLIP3

CLIP3 (англ. CAP-Gly domain containing linker protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 547 амінокислот, а молекулярна маса — 59 560.

CLIP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CP0
Ідентифікатори
Символи	CLIP3, CLIPR-59, CLIPR59, RSNL1, CAP-Gly domain containing linker protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 607382 MGI: 1923936 HomoloGene: 9176 GeneCards: CLIP3
Онтологія гена Молекулярна функція • ganglioside binding • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • early endosome membrane • мембрана • клітинна мембрана • recycling endosome membrane • Golgi stack • membrane raft • trans-Golgi network Біологічний процес • peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation • negative regulation of microtubule polymerization • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • membrane biogenesis • positive regulation of endocytosis • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of glucose transmembrane transport • fat cell differentiation • positive regulation of protein localization to plasma membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25999	76686
Ensembl	ENSG00000105270	ENSMUSG00000013921
UniProt	Q96DZ5	B9EHT4
RefSeq (мРНК)	NM_015526 NM_001199570	NM_001081114 NM_001360763 NM_001360764
RefSeq (білок)	NP_001186499 NP_056341	NP_001074583 NP_001347692 NP_001347693
Локус (UCSC)	Хр. 19: 36.01 – 36.03 Mb	Хр. 7: 29.99 – 30.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTKTDPAPMA		PPPRGEEEEE		EEEDEPVPEA		PSPTQERRQK		PVVHPSAPAP
LPKDYAFTFF		DPNDPACQEI		LFDPQTTIPE		LFAIVRQWVP		QVQHKIDVIG
NEILRRGCHV		NDRDGLTDMT		LLHYACKAGA		HGVGDPAAAV		RLSQQLLALG
ADVTLRSRWT		NMNALHYAAY		FDVPDLVRVL		LKGARPRVVN		STCSDFNHGS
ALHIAASSLC		LGAAKCLLEH		GANPALRNRK		GQVPAEVVPD		PMDMSLDKAE
AALVAKELRT		LLEEAVPLSC		ALPKVTLPNY		DNVPGNLMLS		ALGLRLGDRV
LLDGQKTGTL		RFCGTTEFAS		GQWVGVELDE		PEGKNDGSVG		GVRYFICPPK
QGLFASVSKI		SKAVDAPPSS		VTSTPRTPRM		DFSRVTGKGR		REHKGKKKTP
SSPSLGSLQQ		RDGAKAEVGD		QVLVAGQKQG		IVRFYGKTDF		APGYWYGIEL
DQPTGKHDGS		VFGVRYFTCP		PRHGVFAPAS		RIQRIGGSTD		SPGDSVGAKK
VHQVTMTQPK		RTFTTVRTPK		DIASENSISR		LLFCCWFPWM		LRAEMQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до фосфопротеїнів, ліпопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ding J., Du K. (2009). ClipR-59 interacts with Akt and regulates Akt cellular compartmentalization. Mol. Cell. Biol. 29: 1459—1471. PMID 19139280 DOI:10.1128/MCB.00754-08
• Ren W., Sun Y., Du K. (2013). DHHC17 palmitoylates ClipR-59 and modulates ClipR-59 association with the plasma membrane. Mol. Cell. Biol. 33: 4255—4265. PMID 24001771 DOI:10.1128/MCB.00527-13
• Lemonidis K., Sanchez-Perez M.C., Chamberlain L.H. (2015). Identification of a novel sequence motif recognized by the ankyrin repeat domain of zDHHC17/13 S-acyltransferases. J. Biol. Chem. 290: 21939—21950. PMID 26198635 DOI:10.1074/jbc.M115.657668

Див. також

• Хромосома 19