CLIC6

CLIC6 (англ. Chloride intracellular channel 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 704 амінокислот, а молекулярна маса — 73 012.

CLIC6
Ідентифікатори
Символи	CLIC6, CLIC1L, chloride intracellular channel 6
Зовнішні ІД	OMIM: 615321 MGI: 2146607 HomoloGene: 43154 GeneCards: CLIC6
Онтологія гена Молекулярна функція • voltage-gated ion channel activity • glutathione transferase activity • chloride channel activity • D2 dopamine receptor binding • D3 dopamine receptor binding • D4 dopamine receptor binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • chloride channel complex • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • regulation of ion transmembrane transport • chloride transport • ion transport • glutathione metabolic process • chloride transmembrane transport • GO:0015915 транспорт • ion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54102	209195
Ensembl	ENSG00000159212	ENSMUSG00000022949
UniProt	Q96NY7	Q8BHB9
RefSeq (мРНК)	NM_053277 NM_001317009	NM_172469
RefSeq (білок)	NP_001303938 NP_444507	NP_766057
Локус (UCSC)	Хр. 21: 34.67 – 34.72 Mb	Хр. 16: 92.28 – 92.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAAEPEGV		APGPQGPPEV		PAPLAERPGE		PGAAGGEAEG		PEGSEGAEEA
PRGAAAVKEA		GGGGPDRGPE		AEARGTRGAH		GETEAEEGAP		EGAEVPQGGE
ETSGAQQVEG		ASPGRGAQGE		PRGEAQREPE		DSAAPERQEE		AEQRPEVPEG
SASGEAGDSV		DAEGPLGDNI		EAEGPAGDSV		EAEGRVGDSV		DAEGPAGDSV
DAEGPLGDNI		QAEGPAGDSV		DAEGRVGDSV		DAEGPAGDSV		DAEGRVGDSV
EAGDPAGDGV		EAGVPAGDSV		EAEGPAGDSM		DAEGPAGRAR		RVSGEPQQSG
DGSLSPQAEA		IEVAAGESAG		RSPGELAWDA		AEEAEVPGVK		GSEEAAPGDA
RADAGEDRVG		DGPQQEPGED		EERRERSPEG		PREEEAAGGE		EESPDSSPHG
EASRGAAEPE		AQLSNHLAEE		GPAEGSGEAA		RVNGRREDGE		ASEPRALGQE
HDITLFVKVK		LTALGCSRIA		IKKYLRAGYD		GESIGNCPFS		QRLFMILWLK
GVIFNVTTVD		LKRKPADLQN		LAPGTNPPFM		TFDGEVKTDV		NKIEEFLEEK
LAPPRYPKLG		TQHPESNSAG		NDVFAKFSAF		IKNTKKDANE		IHEKNLLKAL
RKLDNYLNSP		LPDEIDAYST		EDVTVSGRKF		LDGDELTLAD		CNLLPKLHII
KIVAKKYRDF		EFPSEMTGIW		RYLNNAYARD		EFTNTCPADQ		EIEHAYSDVA
KRMK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 21