CIZ1

CIZ1 (англ. CDKN1A interacting zinc finger protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 898 амінокислот, а молекулярна маса — 100 045.

CIZ1
Ідентифікатори
Символи	CIZ1, LSFR1, NP94, ZNF356, CDKN1A interacting zinc finger protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611420 MGI: 1920234 HomoloGene: 8112 GeneCards: CIZ1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25792	68379
Ensembl	ENSG00000148337	ENSMUSG00000039205
UniProt	Q9ULV3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001131015 NM_001131016 NM_001131017 NM_001131018 NM_001257975 NM_001257976 NM_012127	NM_001252534 NM_001252536 NM_001252537 NM_001252538 NM_028412
RefSeq (білок)	NP_001124487 NP_001124488 NP_001124489 NP_001124490 NP_001244904 NP_001244905 NP_036259	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 9: 128.16 – 128.2 Mb	Хр. 2: 32.24 – 32.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSQQQQQQL		QQQQQQLQQL		QQQQLQQQQL		QQQQLLQLQQ		LLQQSPPQAP
LPMAVSRGLP		PQQPQQPLLN		LQGTNSASLL		NGSMLQRALL		LQQLQGLDQF
AMPPATYDTA		GLTMPTATLG		NLRGYGMASP		GLAAPSLTPP		QLATPNLQQF
FPQATRQSLL		GPPPVGVPMN		PSQFNLSGRN		PQKQARTSSS		TTPNRKDSSS
QTMPVEDKSD		PPEGSEEAAE		PRMDTPEDQD		LPPCPEDIAK		EKRTPAPEPE
PCEASELPAK		RLRSSEEPTE		KEPPGQLQVK		AQPQARMTVP		KQTQTPDLLP
EALEAQVLPR		FQPRVLQVQA		QVQSQTQPRI		PSTDTQVQPK		LQKQAQTQTS
PEHLVLQQKQ		VQPQLQQEAE		PQKQVQPQVQ		PQAHSQGPRQ		VQLQQEAEPL
KQVQPQVQPQ		AHSQPPRQVQ		LQLQKQVQTQ		TYPQVHTQAQ		PSVQPQEHPP
AQVSVQPPEQ		THEQPHTQPQ		VSLLAPEQTP		VVVHVCGLEM		PPDAVEAGGG
MEKTLPEPVG		TQVSMEEIQN		ESACGLDVGE		CENRAREMPG		VWGAGGSLKV
TILQSSDSRA		FSTVPLTPVP		RPSDSVSSTP		AATSTPSKQA		LQFFCYICKA
SCSSQQEFQD		HMSEPQHQQR		LGEIQHMSQA		CLLSLLPVPR		DVLETEDEEP
PPRRWCNTCQ		LYYMGDLIQH		RRTQDHKIAK		QSLRPFCTVC		NRYFKTPRKF
VEHVKSQGHK		DKAKELKSLE		KEIAGQDEDH		FITVDAVGCF		EGDEEEEEDD
EDEEEIEVEE		ELCKQVRSRD		ISREEWKGSE		TYSPNTAYGV		DFLVPVMGYI
CRICHKFYHS		NSGAQLSHCK		SLGHFENLQK		YKAAKNPSPT		TRPVSRRCAI
NARNALTALF		TSSGRPPSQP		NTQDKTPSKV		TARPSQPPLP		RRSTRLKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Mitsui K., Matsumoto A., Ohtsuka S., Ohtsubo M., Yoshimura A. (1999). Cloning and characterization of a novel p21(Cip1/Waf1)-interacting zinc finger protein, ciz1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 264: 457—464. PMID 10529385 DOI:10.1006/bbrc.1999.1516
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Warder D.E., Keherly M.J. (2003). Ciz1, Cip1 interacting zinc finger protein 1 binds the consensus DNA sequence ARYSR(0-2)YYAC. J. Biomed. Sci. 10: 406—417. PMID 12824700 DOI:10.1007/BF02256432
• Gilley J., Fried M. (1999). Extensive gene order differences within regions of conserved synteny between the Fugu and human genomes: implications for chromosomal evolution and the cloning of disease genes. Hum. Mol. Genet. 8: 1313—1320. PMID 10369878 DOI:10.1093/hmg/8.7.1313
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 9