CHTOP

CHTOP
Ідентифікатори
Символи	CHTOP, C1orf77, FL-SRAG, FOP, SRAG, SRAG-3, SRAG-5, pp7704, chromatin target of PRMT1, C10orf77
Зовнішні ІД	OMIM: 614206 MGI: 1913761 HomoloGene: 134556 GeneCards: CHTOP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methyl-CpG binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• nuclear speck; • ядерце; • transcription export complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• mRNA transport; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of ATP-dependent activity; • positive regulation of helicase activity; • positive regulation of histone methylation; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell population proliferation; • RNA export from nucleus; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA export from nucleus; • mRNA 3'-end processing; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	26097
	66511
	ENSG00000160679
	ENSMUSG00000001017
	Q9Y3Y2
	Q9CY57
	NM_001206612; NM_001244664; NM_015607; NM_001317077
NM_001293776; NM_001293777; NM_001293778; NM_001293779; NM_001293780;
	NM_001293781; NM_001293782; NM_023215
	NP_001193541; NP_001231593; NP_001304006; NP_056422
NP_001280705; NP_001280706; NP_001280707; NP_001280708; NP_001280709;
	NP_001280710; NP_001280711; NP_075704
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHTOP (англ. Chromatin target of PRMT1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 248 амінокислот, а молекулярна маса — 26 397^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAQSAPKVV	LKSTTKMSLN	ERFTNMLKNK	QPTPVNIRAS	MQQQQQLASA
RNRRLAQQME	NRPSVQAALK	LKQSLKQRLG	KSNIQARLGR	PIGALARGAI
GGRGLPIIQR	GLPRGGLRGG	RATRTLLRGG	MSLRGQNLLR	GGRAVAPRMG
LRRGGVRGRG	GPGRGGLGRG	AMGRGGIGGR	GRGMIGRGRG	GFGGRGRGRG
RGRGALARPV	LTKEQLDNQL	DAYMSKTKGH	LDAELDAYMA	QTDPETND

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zullo A.J., Michaud M., Zhang W., Grusby M.J. (2009). Identification of the small protein rich in arginine and glycine (SRAG): a newly identified nucleolar protein that can regulate cell proliferation. J. Biol. Chem. 284: 12504—12511. PMID 19254951 DOI:10.1074/jbc.M809436200
Teng I.F., Wilson S.A. (2013). Mapping interactions between mRNA export factors in living cells. PLoS ONE. 8: E67676—E67676. PMID 23826332 DOI:10.1371/journal.pone.0067676

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24511 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y3Y2 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24511 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y3Y2 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]