CHRNB2

CHRNB2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2K58, 2K59, 2KSR, 2LM2
Ідентифікатори
Символи	CHRNB2, EFNL3, nAChRB2, cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 118507 MGI: 87891 HomoloGene: 595 GeneCards: CHRNB2
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal dominant nocturnal frontal lobe epilepsy 3
Реагує на сполуку
	pozanicline, ispronicline
Онтологія гена
Молекулярна функція	• acetylcholine binding; • acetylcholine receptor activity; • ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ligand-gated ion channel activity; • protein heterodimerization activity; • extracellular ligand-gated ion channel activity; • acetylcholine-gated cation-selective channel activity; • transmembrane signaling receptor activity; • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential;
Клітинна компонента	• acetylcholine-gated channel complex; • integral component of membrane; • postsynaptic membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • синапс; • міжклітинні контакти; • external side of plasma membrane; • integral component of plasma membrane; • neuron projection; • plasma membrane raft; • dopaminergic synapse; • cholinergic synapse; • integral component of presynaptic membrane; • integral component of postsynaptic specialization membrane;
Біологічний процес	• visual learning; • regulation of synaptic transmission, dopaminergic; • response to cocaine; • smooth muscle contraction; • regulation of circadian sleep/wake cycle, REM sleep; • regulation of dopamine secretion; • response to hypoxia; • associative learning; • когнітивність; • locomotory behavior; • protein heterooligomerization; • central nervous system neuron axonogenesis; • optic nerve morphogenesis; • regulation of synapse assembly; • regulation of membrane potential; • response to nicotine; • membrane depolarization; • nervous system process; • synaptic transmission, cholinergic; • ion transport; • слух; • навчення; • пам'ять; • negative regulation of action potential; • regulation of dopamine metabolic process; • behavioral response to nicotine; • regulation of dendrite morphogenesis; • B cell activation; • neuromuscular synaptic transmission; • synaptic transmission involved in micturition; • positive regulation of dopamine secretion; • positive regulation of B cell proliferation; • regulation of circadian sleep/wake cycle, non-REM sleep; • vestibulocochlear nerve development; • conditioned taste aversion; • GO:0015915 транспорт; • соціальна поведінка; • потенціал дії; • sensory perception of pain; • lateral geniculate nucleus development; • positive regulation of synaptic transmission, dopaminergic; • response to ethanol; • central nervous system projection neuron axonogenesis; • calcium ion transport; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • зір; • ion transmembrane transport; • regulation of postsynaptic membrane potential; • excitatory postsynaptic potential; • acetylcholine receptor signaling pathway; • chemical synaptic transmission; • response to acetylcholine; • regulation of synaptic vesicle exocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1141
	11444
	ENSG00000160716
	ENSMUSG00000027950
	P17787
	Q9ERK7
	NM_000748
	NM_009602
	NP_000739
	NP_033732
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHRNB2 (англ. Cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 57 019^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARRCGPVAL	LLGFGLLRLC	SGVWGTDTEE	RLVEHLLDPS	RYNKLIRPAT
NGSELVTVQL	MVSLAQLISV	HEREQIMTTN	VWLTQEWEDY	RLTWKPEEFD
NMKKVRLPSK	HIWLPDVVLY	NNADGMYEVS	FYSNAVVSYD	GSIFWLPPAI
YKSACKIEVK	HFPFDQQNCT	MKFRSWTYDR	TEIDLVLKSE	VASLDDFTPS
GEWDIVALPG	RRNENPDDST	YVDITYDFII	RRKPLFYTIN	LIIPCVLITS
LAILVFYLPS	DCGEKMTLCI	SVLLALTVFL	LLISKIVPPT	SLDVPLVGKY
LMFTMVLVTF	SIVTSVCVLN	VHHRSPTTHT	MAPWVKVVFL	EKLPALLFMQ
QPRHHCARQR	LRLRRRQRER	EGAGALFFRE	APGADSCTCF	VNRASVQGLA
GAFGAEPAPV	AGPGRSGEPC	GCGLREAVDG	VRFIADHMRS	EDDDQSVSED
WKYVAMVIDR	LFLWIFVFVC	VFGTIGMFLQ	PLFQNYTTTT	FLHSDHSAPS
SK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Anand R., Lindstrom J. (1990). Nucleotide sequence of the human nicotinic acetylcholine receptor beta 2 subunit gene. Nucleic Acids Res. 18: 4272—4272. PMID 2377478 DOI:10.1093/nar/18.14.4272
Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
Rempel N., Heyers S., Engels H., Sleegers E., Steinlein O.K. (1998). The structures of the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta2- and alpha3-subunit genes (CHRNB2 and CHRNA3). Hum. Genet. 103: 645—653. PMID 9921897 DOI:10.1007/s004390050885
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kouvatsos N., Giastas P., Chroni-Tzartou D., Poulopoulou C., Tzartos S.J. (2016). Crystal structure of a human neuronal nAChR extracellular domain in pentameric assembly: Ligand-bound alpha2 homopentamer. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 9635—9640. PMID 27493220 DOI:10.1073/PNAS.1602619113
Bondarenko V., Tillman T., Xu Y., Tang P. (2010). NMR structure of the transmembrane domain of the n-acetylcholine receptor beta2 subunit. Biochim. Biophys. Acta. 1798: 1608—1614. PMID 20441771 DOI:10.1016/j.bbamem.2010.04.014

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHRNB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1962 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P17787 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CHRNB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic beta 2 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1962 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, P17787 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]