CHRD

CHRD (англ. Chordin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 955 амінокислот, а молекулярна маса — 102 032.

CHRD
Ідентифікатори
Символи	CHRD, chordin
Зовнішні ІД	OMIM: 603475 MGI: 1313268 HomoloGene: 2774 GeneCards: CHRD
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syndecan binding • GO:0019974 cytokine binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • pattern specification process • skeletal system development • mesoderm formation • gastrulation with mouth forming second • negative regulation of osteoblast differentiation • floor plate development • negative regulation of BMP signaling pathway • multicellular organism development • central nervous system development • negative regulation of cell migration • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • osteoblast differentiation • forebrain development • dorsal/ventral pattern formation • BMP signaling pathway involved in spinal cord dorsal/ventral patterning • positive regulation of cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8646	12667
Ensembl	ENSG00000090539	ENSMUSG00000006958
UniProt	Q9H2X0	Q9Z0E2
RefSeq (мРНК)	NM_001304472 NM_001304473 NM_001304474 NM_003741 NM_177978 NM_177979	NM_001278041 NM_009893 NM_001354995 NM_001354996
RefSeq (білок)	NP_001291401 NP_001291402 NP_001291403 NP_003732	NP_001264970 NP_034023 NP_001341924 NP_001341925
Локус (UCSC)	Хр. 3: 184.38 – 184.39 Mb	Хр. 16: 20.55 – 20.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSLPAPPAP		LLLLGLLLLG		SRPARGAGPE		PPVLPIRSEK		EPLPVRGAAG
CTFGGKVYAL		DETWHPDLGE		PFGVMRCVLC		ACEAPQWGRR		TRGPGRVSCK
NIKPECPTPA		CGQPRQLPGH		CCQTCPQERS		SSERQPSGLS		FEYPRDPEHR
SYSDRGEPGA		EERARGDGHT		DFVALLTGPR		SQAVARARVS		LLRSSLRFSI
SYRRLDRPTR		IRFSDSNGSV		LFEHPAAPTQ		DGLVCGVWRA		VPRLSLRLLR
AEQLHVALVT		LTHPSGEVWG		PLIRHRALAA		ETFSAILTLE		GPPQQGVGGI
TLLTLSDTED		SLHFLLLFRG		LLEPRSGGLT		QVPLRLQILH		QGQLLRELQA
NVSAQEPGFA		EVLPNLTVQE		MDWLVLGELQ		MALEWAGRPG		LRISGHIAAR
KSCDVLQSVL		CGADALIPVQ		TGAAGSASLT		LLGNGSLIYQ		VQVVGTSSEV
VAMTLETKPQ		RRDQRTVLCH		MAGLQPGGHT		AVGICPGLGA		RGAHMLLQNE
LFLNVGTKDF		PDGELRGHVA		ALPYCGHSAR		HDTLPVPLAG		ALVLPPVKSQ
AAGHAWLSLD		THCHLHYEVL		LAGLGGSEQG		TVTAHLLGPP		GTPGPRRLLK
GFYGSEAQGV		VKDLEPELLR		HLAKGMASLM		ITTKGSPRGE		LRGQVHIANQ
CEVGGLRLEA		AGAEGVRALG		APDTASAAPP		VVPGLPALAP		AKPGGPGRPR
DPNTCFFEGQ		QRPHGARWAP		NYDPLCSLCT		CQRRTVICDP		VVCPPPSCPH
PVQAPDQCCP		VCPEKQDVRD		LPGLPRSRDP		GEGCYFDGDR		SWRAAGTRWH
PVVPPFGLIK		CAVCTCKGGT		GEVHCEKVQC		PRLACAQPVR		VNPTDCCKQC
PVGSGAHPQL		GDPMQADGPR		GCRFAGQWFP		ESQSWHPSVP		PFGEMSCITC
RCGAGVPHCE		RDDCSLPLSC		GSGKESRCCS		RCTAHRRPAP		ETRTDPELEK
EAEGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Millet C., Lemaire P., Orsetti B., Guglielmi P., Francois V. (2001). The human chordin gene encodes several differentially expressed spliced variants with distinct BMP opposing activities. Mech. Dev. 106: 85—96. PMID 11472837 DOI:10.1016/S0925-4773(01)00423-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 3