CHIT1

CHIT1 (англ. Chitinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 51 681.

CHIT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GUV, 1HKI, 1HKJ, 1HKK, 1HKM, 1LG1, 1LG2, 1LQ0, 1WAW, 1WB0, 4WJX, 4WK9, 4WKA, 4WKF, 4WKH, 5HBF
Ідентифікатори
Символи	CHIT1, CHI3, CHIT, CHITD, chitinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600031 MGI: 1919134 HomoloGene: 68318 GeneCards: CHIT1
Онтологія гена Молекулярна функція • chitinase activity • chitin binding • hydrolase activity • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • endochitinase activity • hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds Клітинна компонента • extracellular region • лізосома • specific granule lumen • tertiary granule lumen • міжклітинний простір Біологічний процес • chitin catabolic process • chitin metabolic process • polysaccharide catabolic process • обмін речовин • response to bacterium • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • neutrophil degranulation • polysaccharide digestion • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1118	71884
Ensembl	ENSG00000133063	ENSMUSG00000026450
UniProt	Q13231	Q9D7Q1
RefSeq (мРНК)	NM_001256125 NM_001270509 NM_003465	NM_001284524 NM_001284525 NM_027979
RefSeq (білок)	NP_001243054 NP_003456	NP_001271453 NP_001271454 NP_082255
Локус (UCSC)	Хр. 1: 203.21 – 203.27 Mb	Хр. 1: 134.04 – 134.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRSVAWAGF		MVLLMIPWGS		AAKLVCYFTN		WAQYRQGEAR		FLPKDLDPSL
CTHLIYAFAG		MTNHQLSTTE		WNDETLYQEF		NGLKKMNPKL		KTLLAIGGWN
FGTQKFTDMV		ATANNRQTFV		NSAIRFLRKY		SFDGLDLDWE		YPGSQGSPAV
DKERFTTLVQ		DLANAFQQEA		QTSGKERLLL		SAAVPAGQTY		VDAGYEVDKI
AQNLDFVNLM		AYDFHGSWEK		VTGHNSPLYK		RQEESGAAAS		LNVDAAVQQW
LQKGTPASKL		ILGMPTYGRS		FTLASSSDTR		VGAPATGSGT		PGPFTKEGGM
LAYYEVCSWK		GATKQRIQDQ		KVPYIFRDNQ		WVGFDDVESF		KTKVSYLKQK
GLGGAMVWAL		DLDDFAGFSC		NQGRYPLIQT		LRQELSLPYL		PSGTPELEVP
KPGQPSEPEH		GPSPGQDTFC		QGKADGLYPN		PRERSSFYSC		AAGRLFQQSC
PTGLVFSNSC		KCCTWN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, глікозидаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як вуглеводний обмін, альтернативний сплайсинг. Локалізований у лізосомі. Також секретований назовні.

Література

• Boot R.G., Renkema G.H., Strijland A., van Zonneveld A.J., Aerts J.M.F.G. (1995). Cloning of a cDNA encoding chitotriosidase, a human chitinase produced by macrophages. J. Biol. Chem. 270: 26252—26256. PMID 7592832 DOI:10.1074/jbc.270.44.26252
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Renkema G.H., Boot R.G., Muijsers A.O., Donker-Koopman W.E., Aerts J.M.F.G. (1995). Purification and characterization of human chitotriosidase, a novel member of the chitinase family of proteins. J. Biol. Chem. 270: 2198—2202. PMID 7836450 DOI:10.1074/jbc.270.5.2198
• Grace M.E., Balwani M., Nazarenko I., Prakash-Cheng A., Desnick R.J. (2007). Type 1 Gaucher disease: null and hypomorphic novel chitotriosidase mutations-implications for diagnosis and therapeutic monitoring. Hum. Mutat. 28: 866—873. PMID 17464953 DOI:10.1002/humu.20524

Див. також

• Хромосома 1