CHI3L2

CHI3L2 (англ. Chitinase 3 like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 501.

CHI3L2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AY1, 4P8U, 4P8V, 4P8W, 4P8X
Ідентифікатори
Символи	CHI3L2, CHIL2, YKL-39, YKL39, chitinase 3 like 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601526 HomoloGene: 74516 GeneCards: CHI3L2
Онтологія гена Молекулярна функція • chitinase activity • chitin binding • hydrolase activity • carbohydrate binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • цитоплазма Біологічний процес • chitin catabolic process • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1117	180628
Ensembl	ENSG00000064886	WBGene00000503
UniProt	Q15782	Q11174
RefSeq (мРНК)	NM_004000 NM_001025197 NM_001025199	NM_076187
RefSeq (білок)	NP_001020368 NP_001020370 NP_003991	NP_508588
Локус (UCSC)	Хр. 1: 111.2 – 111.24 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGATTMDQKS		LWAGVVVLLL		LQGGSAYKLV		CYFTNWSQDR		QEPGKFTPEN
IDPFLCSHLI		YSFASIENNK		VIIKDKSEVM		LYQTINSLKT		KNPKLKILLS
IGGYLFGSKG		FHPMVDSSTS		RLEFINSIIL		FLRNHNFDGL		DVSWIYPDQK
ENTHFTVLIH		ELAEAFQKDF		TKSTKERLLL		TAGVSAGRQM		IDNSYQVEKL
AKDLDFINLL		SFDFHGSWEK		PLITGHNSPL		SKGWQDRGPS		SYYNVEYAVG
YWIHKGMPSE		KVVMGIPTYG		HSFTLASAET		TVGAPASGPG		AAGPITESSG
FLAYYEICQF		LKGAKITRLQ		DQQVPYAVKG		NQWVGYDDVK		SMETKVQFLK
NLNLGGAMIW		SIDMDDFTGK		SCNQGPYPLV		QAVKRSLGSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Секретований назовні.

Література

• Hu B., Trinh K., Figueira W.F., Price P.A. (1996). Isolation and sequence of a novel human chondrocyte protein related to mammalian members of the chitinase protein family. J. Biol. Chem. 271: 19415—19420. PMID 8702629 DOI:10.1074/jbc.271.32.19415
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1