CHI3L1

CHI3L1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1HJV, 1HJW, 1HJX, 1NWR, 1NWS, 1NWT, 1NWU
Ідентифікатори
Символи	CHI3L1, chitinase 3-like 1 (cartilage glycoprotein-39), ASRT7, CGP-39, GP-39, GP39, HC-gp39, HCGP-3P, YKL-40, YKL40, YYL-40, hCGP-39, chitinase 3 like 1, YK-40
Зовнішні ІД	OMIM: 601525 MGI: 1340899 HomoloGene: 55569 GeneCards: CHI3L1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• chitinase activity; • extracellular matrix structural constituent; • chitin binding; • carbohydrate binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • екзосома; • extracellular region; • міжклітинний простір; • specific granule lumen; • цитоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця;
Біологічний процес	• positive regulation of protein kinase B signaling; • response to interleukin-1; • response to interleukin-6; • lung development; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to mechanical stimulus; • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity; • positive regulation of angiogenesis; • response to tumor necrosis factor; • cartilage development; • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation; • cellular response to interleukin-1; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • inflammatory response; • GO:0097285 апоптоз; • neutrophil degranulation; • chitin catabolic process; • carbohydrate metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1116
	12654
	ENSG00000133048
	ENSMUSG00000064246
	P36222
	Q61362
	NM_001276
	NM_007695; NM_001374626
	NP_001267; NP_001267.2
	NP_031721; NP_001361555
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHI3L1 (англ. Chitinase 3 like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 383 амінокислот, а молекулярна маса — 42 625^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGVKASQTGF	VVLVLLQCCS	AYKLVCYYTS	WSQYREGDGS	CFPDALDRFL
CTHIIYSFAN	ISNDHIDTWE	WNDVTLYGML	NTLKNRNPNL	KTLLSVGGWN
FGSQRFSKIA	SNTQSRRTFI	KSVPPFLRTH	GFDGLDLAWL	YPGRRDKQHF
TTLIKEMKAE	FIKEAQPGKK	QLLLSAALSA	GKVTIDSSYD	IAKISQHLDF
ISIMTYDFHG	AWRGTTGHHS	PLFRGQEDAS	PDRFSNTDYA	VGYMLRLGAP
ASKLVMGIPT	FGRSFTLASS	ETGVGAPISG	PGIPGRFTKE	AGTLAYYEIC
DFLRGATVHR	ILGQQVPYAT	KGNQWVGYDD	QESVKSKVQY	LKDRQLAGAM
VWALDLDDFQ	GSFCGQDLRF	PLTNAIKDAL	AAT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

Rehli M., Krause S.W., Andressen R. (1997). Molecular characterization of the gene for human cartilage gp-39 (CHI3L1), a member of the chitinase protein family and marker for late stages of macrophage differentiation. Genomics. 43: 221—225. PMID 9244440 DOI:10.1006/geno.1997.4778
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nyirkos P., Golds E.E. (1990). Human synovial cells secrete a 39 kDa protein similar to a bovine mammary protein expressed during the non-lactating period. Biochem. J. 269: 265—268. PMID 2375755 DOI:10.1042/bj2690265
Mizoguchi E. (2006). Chitinase 3-like-1 exacerbates intestinal inflammation by enhancing bacterial adhesion and invasion in colonic epithelial cells. Gastroenterology. 130: 398—411. PMID 16472595 DOI:10.1053/j.gastro.2005.12.007
Houston D.R., Recklies A.D., Krupa J.C., van Aalten D.M.F. (2003). Structure and ligand-induced conformational change of the 39-kDa glycoprotein from human articular chondrocytes. J. Biol. Chem. 278: 30206—30212. PMID 12775711 DOI:10.1074/jbc.M303371200
Fusetti F., Pijning T., Kalk K.H., Bos E., Dijkstra B.W. (2003). Crystal structure and carbohydrate-binding properties of the human cartilage glycoprotein-39. J. Biol. Chem. 278: 37753—37760. PMID 12851408 DOI:10.1074/jbc.M303137200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1932 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P36222 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1932 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P36222 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]