CHAF1B

CHAF1B (англ. Chromatin assembly factor 1 subunit B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 559 амінокислот, а молекулярна маса — 61 493.

CHAF1B
Ідентифікатори
Символи	CHAF1B, CAF-1, CAF-IP60, CAF1, CAF1A, CAF1P60, MPHOSPH7, MPP7, chromatin assembly factor 1 subunit B
Зовнішні ІД	OMIM: 601245 MGI: 1314881 HomoloGene: 48346 GeneCards: CHAF1B
Онтологія гена Молекулярна функція • unfolded protein binding • GO:0031493 histone binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • CAF-1 complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • реплікація ДНК • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8208	110749
Ensembl	ENSG00000159259	ENSMUSG00000022945
UniProt	Q13112	Q9D0N7
RefSeq (мРНК)	NM_005441	NM_028083
RefSeq (білок)	NP_005432	NP_082359
Локус (UCSC)	Хр. 21: 36.39 – 36.42 Mb	Хр. 16: 93.68 – 93.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVITCEIAW		HNKEPVYSLD		FQHGTAGRIH		RLASAGVDTN		VRIWKVEKGP
DGKAIVEFLS		NLARHTKAVN		VVRFSPTGEI		LASGGDDAVI		LLWKVNDNKE
PEQIAFQDED		EAQLNKENWT		VVKTLRGHLE		DVYDICWATD		GNLMASASVD
NTAIIWDVSK		GQKISIFNEH		KSYVQGVTWD		PLGQYVATLS		CDRVLRVYSI
QKKRVAFNVS		KMLSGIGAEG		EARSYRMFHD		DSMKSFFRRL		SFTPDGSLLL
TPAGCVESGE		NVMNTTYVFS		RKNLKRPIAH		LPCPGKATLA		VRCCPVYFEL
RPVVETGVEL		MSLPYRLVFA		VASEDSVLLY		DTQQSFPFGY		VSNIHYHTLS
DISWSSDGAF		LAISSTDGYC		SFVTFEKDEL		GIPLKEKPVL		NMRTPDTAKK
TKSQTHRGSS		PGPRPVEGTP		ASRTQDPSSP		GTTPPQARQA		PAPTVIRDPP
SITPAVKSPL		PGPSEEKTLQ		PSSQNTKAHP		SRRVTLNTLQ		AWSKTTPRRI
NLTPLKTDTP		PSSVPTSVIS		TPSTEEIQSE		TPGDAQGSPP		ELKRPRLDEN
KGGTESLDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Kaufman P.D., Kobayashi R., Kessler N., Stillman B. (1995). The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I: a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication. Cell. 81: 1105—1114. PMID 7600578 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80015-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Matsumoto-Taniura N., Pirollet F., Monroe R., Gerace L., Westendorf J.M. (1996). Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning. Mol. Biol. Cell. 7: 1455—1469. PMID 8885239 DOI:10.1091/mbc.7.9.1455
• Martini E., Roche D.M., Marheineke K., Verreault A., Almouzni G. (1998). Recruitment of phosphorylated chromatin assembly factor 1 to chromatin after UV irradiation of human cells. J. Cell Biol. 143: 563—575. PMID 9813080 DOI:10.1083/jcb.143.3.563
• Marheineke K., Krude T. (1998). Nucleosome assembly activity and intracellular localization of human CAF-1 changes during the cell division cycle. J. Biol. Chem. 273: 15279—15286. PMID 9614144 DOI:10.1074/jbc.273.24.15279
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 21