AGAP1

AGAP1 (англ. ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 857 амінокислот, а молекулярна маса — 94 470.

AGAP1
Ідентифікатори
Символи	AGAP1, AGAP-1, CENTG2, GGAP1, cnt-g2, ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608651 MGI: 2653690 HomoloGene: 56689 GeneCards: AGAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • phospholipid binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116987	347722
Ensembl	ENSG00000157985	ENSMUSG00000055013
UniProt	Q9UPQ3	Q8BXK8
RefSeq (мРНК)	NM_001037131 NM_001244888 NM_014914	NM_001037136 NM_178119
RefSeq (білок)	NP_001032208 NP_001231817 NP_055729	NP_001032213 NP_835220
Локус (UCSC)	Хр. 2: 235.49 – 236.13 Mb	Хр. 1: 89.38 – 89.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNYQQQLANS		AAIRAEIQRF		ESVHPNIYSI		YELLERVEEP		VLQNQIREHV
IAIEDAFVNS		QEWTLSRSVP		ELKVGIVGNL		ASGKSALVHR		YLTGTYVQEE
SPEGGRFKKE		IVVDGQSYLL		LIRDEGGPPE		AQFAMWVDAV		IFVFSLEDEI
SFQTVYHYYS		RMANYRNTSE		IPLVLVGTQD		AISSANPRVI		DDARARKLSN
DLKRCTYYET		CATYGLNVER		VFQDVAQKIV		ATRKKQQLSI		GPCKSLPNSP
SHSSVCSAQV		SAVHISQTSN		GGGSLSDYSS		SVPSTPSTSQ		KELRIDVPPT
ANTPTPVRKQ		SKRRSNLFTS		RKGSDPDKEK		KGLESRADSI		GSGRAIPIKQ
GMLLKRSGKS		LNKEWKKKYV		TLCDNGVLTY		HPSLHDYMQN		VHGKEIDLLR
TTVKVPGKRP		PRATSACAPI		SSPKTNGLSK		DMSSLHISPN		SGNVTSASGS
QMASGISLVS		FNSRPDGMHQ		RSYSVSSADQ		WSEATVIANS		AISSDTGLGD
SVCSSPSISS		TTSPKLDPPP		SPHANRKKHR		RKKSTSNFKA		DGLSGTAEEQ
EENFEFIIVS		LTGQTWHFEA		TTYEERDAWV		QAIESQILAS		LQSCESSKNK
SRLTSQSEAM		ALQSIRNMRG		NSHCVDCETQ		NPNWASLNLG		ALMCIECSGI
HRNLGTHLSR		VRSLDLDDWP		VELIKVMSSI		GNELANSVWE		ESSQGRTKPS
VDSTREEKER		WIRAKYEQKL		FLAPLPCTEL		SLGQHLLRAT		ADEDLRTAIL
LLAHGSRDEV		NETCGEGDGR		TALHLACRKG		NVVLAQLLIW		YGVDVTARDA
HGNTALAYAR		QASSQECIDV		LLQYGCPDER		FVLMATPNLS		RRNNNRNNSS
GRVPTII

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Meurer S., Pioch S., Wagner K., Mueller-Esterl W., Gross S. (2004). AGAP1, a novel binding partner of nitric oxide-sensitive guanylyl cyclase. J. Biol. Chem. 279: 49346—49354. PMID 15381706 DOI:10.1074/jbc.M410565200
• Nie Z., Fei J., Premont R.T., Randazzo P.A. (2005). The Arf GAPs AGAP1 and AGAP2 distinguish between the adaptor protein complexes AP-1 and AP-3. J. Cell Sci. 118: 3555—3566. PMID 16079295 DOI:10.1242/jcs.02486

Див. також

• Хромосома 2