CELF6

CELF6 (англ. CUGBP Elav-like family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 481 амінокислот, а молекулярна маса — 50 477.

CELF6
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DGQ
Ідентифікатори
Символи	CELF6, BRUNOL6, CUGBP, Elav-like family member 6, CUGBP Elav-like family member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 612681 GeneCards: CELF6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA splice site selection Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60677	н/д
Ensembl	н/д	н/д
UniProt	Q96J87	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_052840 NM_001172684 NM_001172685	н/д
RefSeq (білок)	NP_001166155 NP_001166156 NP_443072	н/д
Локус (UCSC)	н/д	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAPGGSAQ		PAGPGPRLGF		STADSGVGMS		GLNPGPAVPM		KDHDAIKLFV
GQIPRGLDEQ		DLKPLFEEFG		RIYELTVLKD		RLTGLHKGCA		FLTYCARDSA
LKAQSALHEQ		KTLPGMNRPI		QVKPAASEGR		GEDRKLFVGM		LGKQQGEEDV
RRLFQPFGHI		EECTVLRSPD		GTSKGCAFVK		FGSQGEAQAA		IRGLHGSRTM
AGASSSLVVK		LADTDRERAL		RRMQQMAGHL		GAFHPAPLPL		GACGAYTTAI
LQHQAALLAA		AQGPGLGPVA		AVAAQMQHVA		AFSLVAAPLL		PAAAANSPPG
SGPGTLPGLP		APIGVNGFGP		LTPQTNGQPG		SDTLYNNGLS		PYPAQSPGVA
DPLQQAYAGM		HHYAAAYPSA		YAPVSTAFPQ		QPSALPQQQR		EGPEGCNLFI
YHLPQEFGDA		ELIQTFLPFG		AVVSAKVFVD		RATNQSKCFG		FVSFDNPTSA
QTAIQAMNGF		QIGMKRLKVQ		LKRPKDANRP		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ladd A.N., Nguyen N.H., Malhotra K., Cooper T.A. (2004). CELF6, a member of the CELF family of RNA-binding proteins, regulates muscle-specific splicing enhancer-dependent alternative splicing. J. Biol. Chem. 279: 17756—17764. PMID 14761971 DOI:10.1074/jbc.M310687200

Див. також

• Хромосома 15