CELF5

CELF5 (англ. CUGBP Elav-like family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 52 355.

CELF5
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DNH
Ідентифікатори
Символи	CELF5, BRUNOL-5, BRUNOL5, CELF-5, CUGBP, Elav-like family member 5, CUGBP Elav-like family member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 612680 MGI: 2442333 HomoloGene: 75172 GeneCards: CELF5
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • nucleic acid binding • pre-mRNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • компонент клітини • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA splice site selection Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60680	319586
Ensembl	ENSG00000161082	ENSMUSG00000034818
UniProt	Q8N6W0	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001172673 NM_021938	NM_176954 NM_001311124 NM_001311126 NM_001311127 NM_001374703
RefSeq (білок)	NP_001166144 NP_068757	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 3.22 – 3.3 Mb	Хр. 10: 81.46 – 81.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARLTESEAR		RQQQQLLQPR		PSPVGSSGPE		PPGGQPDGMK		DLDAIKLFVG
QIPRHLDEKD		LKPLFEQFGR		IYELTVLKDP		YTGMHKGCAF		LTYCARDSAI
KAQTALHEQK		TLPGMARPIQ		VKPADSESRG		GRDRKLFVGM		LNKQQSEEDV
LRLFQPFGVI		DECTVLRGPD		GSSKGCAFVK		FSSHTEAQAA		IHALHGSQTM
PGASSSLVVK		FADTDKERTL		RRMQQMVGQL		GILTPSLTLP		FSPYSAYAQA
LMQQQTTVLS		TSGSYLSPGV		AFSPCHIQQI		GAVSLNGLPA		TPIAPASGLH
SPPLLGTTAV		PGLVAPITNG		FAGVVPFPGG		HPALETVYAN		GLVPYPAQSP
TVAETLHPAF		SGVQQYTAMY		PTAAITPIAH		SVPQPPPLLQ		QQQREGPEGC
NLFIYHLPQE		FGDTELTQMF		LPFGNIISSK		VFMDRATNQS		KCFGFVSFDN
PASAQAAIQA		MNGFQIGMKR		LKVQLKRPKD		PGHPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001). The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing. Mol. Cell. Biol. 21: 1285—1296. PMID 11158314 DOI:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001
• Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200

Див. також

• Хромосома 19