CELF4

CELF4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DGP, 2DNK
Ідентифікатори
Символи	CELF4, BRUNOL-4, BRUNOL4, CELF-4, CUGBP, Elav-like family member 4, CUGBP Elav-like family member 4
Зовнішні ІД	OMIM: 612679 MGI: 1932407 HomoloGene: 23202 GeneCards: CELF4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding; • BRE binding; • mRNA binding; • nucleic acid binding; • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding; • pre-mRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• germ cell development; • mRNA processing; • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • Альтернативний сплайсинг; • mRNA splice site selection; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • negative regulation of excitatory postsynaptic potential; • Сплайсинг РНК; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • negative regulation of translation; • regulation of retina development in camera-type eye; • embryo development ending in birth or egg hatching;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	56853
	108013
	ENSG00000101489
	ENSMUSG00000024268
	Q9BZC1
	Q7TSY6
	NM_001025087; NM_001025088; NM_001025089; NM_020180; NM_001330603
NM_001146292; NM_001146293; NM_001146294; NM_001146295; NM_001174074;
	NM_133195
NP_001020258; NP_001020259; NP_001020260; NP_001317532; NP_064565;
	NP_001340624; NP_001340625; NP_001340626; NP_001340627; NP_001340628; NP_001340629; NP_001340630; NP_001340631; NP_001340632; NP_001340634; NP_001340635; NP_001340637; NP_001340638; NP_001340639; NP_001340640; NP_001340641; NP_001340642; NP_001340643; NP_001340644; NP_001340645; NP_001340646; NP_001340647; NP_001340648; NP_001340649; NP_001340650; NP_001340651; NP_001340652; NP_001340653; NP_001340654; NP_001340655; NP_001340656; NP_001340657; NP_001340658; NP_001340659; NP_001340660; NP_001340661; NP_001340662; NP_001340663; NP_001340664; NP_001340665; NP_001340666; NP_001340667; NP_001340668; NP_001340669; NP_001340670; NP_001340671; NP_001340672; NP_001340673; NP_001340674; NP_001340675; NP_001340676; NP_001340677; NP_001340678; NP_001340679; NP_001340680; NP_001340681; NP_001340682; NP_001340683; NP_001340684; NP_001340685; NP_001340686; NP_001340687; NP_001340688; NP_001340689; NP_001340690; NP_001340636
NP_001139764; NP_001139765; NP_001139766; NP_001167545; NP_573458;
	NP_001349204; NP_001349205; NP_001349206; NP_001349207; NP_001349208; NP_001349209; NP_001349210; NP_001349211; NP_001349212; NP_001349213; NP_001349214; NP_001349215; NP_001349217; NP_001349218; NP_001349219; NP_001349220; NP_001349221; NP_001349222; NP_001349223; NP_001349224; NP_001349226; NP_001349228; NP_001349229; NP_001349230; NP_001349231; NP_001349232; NP_001349237; NP_001349238; NP_001349239; NP_001349240; NP_001349242; NP_001349244; NP_001349245; NP_001349252; NP_001349253; NP_001349254; NP_001349255; NP_001349256; NP_001349257; NP_001349258; NP_001349259; NP_001349260; NP_001349261; NP_001349263; NP_001349264; NP_001349265; NP_001349266; NP_001349233; NP_001349251
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CELF4 (англ. CUGBP Elav-like family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486 амінокислот, а молекулярна маса — 51 966^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYIKMATLAN	GQADNASLST	NGLGSSPGSA	GHMNGLSHSP	GNPSTIPMKD
HDAIKLFIGQ	IPRNLDEKDL	KPLFEEFGKI	YELTVLKDRF	TGMHKGCAFL
TYCERESALK	AQSALHEQKT	LPGMNRPIQV	KPADSESRGG	SSCLRQPPSQ
DRKLFVGMLN	KQQSEDDVRR	LFEAFGNIEE	CTILRGPDGN	SKGCAFVKYS
SHAEAQAAIN	ALHGSQTMPG	ASSSLVVKFA	DTDKERTMRR	MQQMAGQMGM
FNPMAIPFGA	YGAYAQALMQ	QQAALMASVA	QGGYLNPMAA	FAAAQMQQMA
ALNMNGLAAA	PMTPTSGGST	PPGITAPAVP	SIPSPIGVNG	FTGLPPQANG
QPAAEAVFAN	GIHPYPAQSP	TAADPLQQAY	AGVQQYAGPA	AYPAAYGQIS
QAFPQPPPMI	PQQQREGPEG	CNLFIYHLPQ	EFGDAELMQM	FLPFGFVSFD
NPASAQTAIQ	AMNGFQIGMK	RLKVQLKRPK	DANRPY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001). The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing. Mol. Cell. Biol. 21: 1285—1296. PMID 11158314 DOI:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200
Gromak N., Matlin A.J., Cooper T.A., Smith C.W. (2003). Antagonistic regulation of alpha-actinin alternative splicing by CELF proteins and polypyrimidine tract binding protein. RNA. 9: 443—456. PMID 12649496 DOI:10.1261/rna.2191903
Singh G., Charlet-B N., Han J., Cooper T.A. (2004). ETR-3 and CELF4 protein domains required for RNA binding and splicing activity in vivo. Nucleic Acids Res. 32: 1232—1241. PMID 14973222 DOI:10.1093/nar/gkh275
Han J., Cooper T.A. (2005). Identification of CELF splicing activation and repression domains in vivo. Nucleic Acids Res. 33: 2769—2780. PMID 15894795 DOI:10.1093/nar/gki561

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14015 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BZC1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14015 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9BZC1 (англ.) . Архів оригіналу за 8 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]