CELF3

CELF3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DNO
Ідентифікатори
Символи	CELF3, BRUNOL1, CAGH4, ERDA4, ETR-1, TNRC4, CUGBP, Elav-like family member 3, CUGBP Elav-like family member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612678 MGI: 1926034 HomoloGene: 48510 GeneCards: CELF3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding; • nucleic acid binding; • 7SK snRNA binding; • pre-mRNA binding; • mRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ядерні тільця; • клітинне ядро; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• flagellated sperm motility; • mRNA processing; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • Сперматогенез; • Сплайсинг РНК; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • nuclear body organization; • ncRNA transcription; • mRNA splice site selection;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	11189
	78784
	ENSG00000159409
	ENSMUSG00000028137
	Q5SZQ8
	Q8CIN6
	NM_001172648; NM_001172649; NM_001291106; NM_001291107; NM_007185
NM_001289613; NM_001289616; NM_001289620; NM_172434; NM_001357784;
	NM_001357785; NM_001357786; NM_001357787
	NP_001166119; NP_001166120; NP_001278035; NP_001278036; NP_009116
NP_001276542; NP_001276545; NP_001276549; NP_766022; NP_001344713;
	NP_001344714; NP_001344715; NP_001344716; NP_001366178; NP_001366179; NP_001366180; NP_001366181; NP_001366182; NP_001366183; NP_001366184; NP_001366185
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CELF3 (англ. CUGBP Elav-like family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 50 548^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKEPDAIKLF	VGQIPRHLEE	KDLKPIFEQF	GRIFELTVIK	DKYTGLHKGC
AFLTYCARDS	ALKAQSALHE	QKTLPGMNRP	IQVKPADSES	RGEDRKLFVG
MLGKQQTDED	VRKMFEPFGT	IDECTVLRGP	DGTSKGCAFV	KFQTHAEAQA
AINTLHSSRT	LPGASSSLVV	KFADTEKERG	LRRMQQVATQ	LGMFSPIALQ
FGAYSAYTQA	LMQQQAALVA	AHSAYLSPMA	TMAAVQMQHM	AAINANGLIA
TPITPSSGTS	TPPAIAATPV	SAIPAALGVN	GYSPVPTQPT	GQPAPDALYP
NGVHPYPAQS	PAAPVDPLQQ	AYAGMQHYTA	AYPAAYSLVA	PAFPQPPALV
AQQPPPPPQQ	QQQQQQQQQQ	QQQREGPDGC	NIFIYHLPQE	FTDSEILQMF
VPFGHVISAK	VFVDRATNQS	KCFGFVSFDN	PASAQAAIQA	MNGFQIGMKR
LKVQLKRPKD	ANRPY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001). The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing. Mol. Cell. Biol. 21: 1285—1296. PMID 11158314 DOI:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11967 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5SZQ8 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11967 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q5SZQ8 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]