CELF1

CELF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CPZ, 2DHS, 2RQ4, 2RQC, 3NMR, 3NNA, 3NNC, 3NNH
Ідентифікатори
Символи	CELF1, BRUNOL2, CUG-BP, CUGBP, CUGBP1, EDEN-BP, NAB50, NAPOR, hNab50, CUGBP, Elav-like family member 1, CUGBP Elav-like family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601074 MGI: 1342295 HomoloGene: 136342 GeneCards: CELF1
Пов'язані генетичні захворювання
	хвороба Альцгеймера
Онтологія гена
Молекулярна функція	• translation repressor activity, mRNA regulatory element binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • BRE binding; • mRNA binding; • pre-mRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• germ cell development; • embryo development; • mRNA processing; • GO:0035194 РНК-інтерференція; • regulation of RNA splicing; • Сплайсинг РНК; • negative regulation of translation; • mRNA splice site selection; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • embryo development ending in birth or egg hatching;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	10658
	13046
	ENSG00000149187
	ENSMUSG00000005506
	Q92879
	P28659
NM_001025596; NM_001172639; NM_001172640; NM_006560; NM_198700;
	NM_001330272
	NM_001244891; NM_001244903; NM_017368; NM_198683
NP_001020767; NP_001166110; NP_001166111; NP_001317201; NP_006551;
	NP_941989; NP_001363298; NP_001363299; NP_001363300; NP_001363301; NP_001363302; NP_001363303; NP_001363305; NP_001363306; NP_001363307; NP_001363308; NP_001363309; NP_001363310; NP_001363311; NP_001363312; NP_001363313; NP_001363314; NP_001363315; NP_001363316; NP_001363317; NP_001363318; NP_001363319; NP_001363320; NP_001363322; NP_001363324; NP_001363325; NP_001363326; NP_001363328; NP_001363335; NP_001363336; NP_001363337; NP_001363338; NP_001363339; NP_001363340; NP_001363341; NP_001363342; NP_001363343; NP_001363344; NP_001363346; NP_001363347; NP_001363348; NP_001363349; NP_001363350; NP_001363351; NP_001363352; NP_001363353; NP_001363354; NP_001363355; NP_001363356; NP_001363357; NP_001363358; NP_001363359; NP_001363360; NP_001363361; NP_001363362; NP_001363363; NP_001363364; NP_001363365; NP_001363366; NP_001363367; NP_001363368; NP_001363369; NP_001363370; NP_001363371; NP_001363372; NP_001363373; NP_001363374; NP_001363375; NP_001363376; NP_001363377; NP_001363378; NP_001363379; NP_001363380; NP_001363381; NP_001363382; NP_001363383; NP_001363384; NP_001363385; NP_001363386; NP_001363387; NP_001363388; NP_001363389; NP_001363390; NP_001363391; NP_001363392; NP_001363304
NP_001231820; NP_001231832; NP_059064; NP_941955; NP_001393093;
	NP_001393094; NP_001393095; NP_001393096; NP_001393097; NP_001393098; NP_001393099; NP_001393100; NP_001393101; NP_001393102; NP_001393103; NP_001393104; NP_001393105; NP_001393106; NP_001393107; NP_001393108; NP_001393109; NP_001393110; NP_001393111; NP_001393112; NP_001393113
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CELF1 (англ. CUGBP Elav-like family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486 амінокислот, а молекулярна маса — 52 063^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNGTLDHPDQ	PDLDAIKMFV	GQVPRTWSEK	DLRELFEQYG	AVYEINVLRD
RSQNPPQSKG	CCFVTFYTRK	AALEAQNALH	NMKVLPGMHH	PIQMKPADSE
KNNAVEDRKL	FIGMISKKCT	ENDIRVMFSS	FGQIEECRIL	RGPDGLSRGC
AFVTFTTRAM	AQTAIKAMHQ	AQTMEGCSSP	MVVKFADTQK	DKEQKRMAQQ
LQQQMQQISA	ASVWGNLAGL	NTLGPQYLAL	YLQLLQQTAS	SGNLNTLSSL
HPMGGLNAMQ	LQNLAALAAA	ASAAQNTPSG	TNALTTSSSP	LSVLTSSGSS
PSSSSSNSVN	PIASLGALQT	LAGATAGLNV	GSLAGMAALN	GGLGSSGLSN
GTGSTMEALT	QAYSGIQQYA	AAALPTLYNQ	NLLTQQSIGA	AGSQKEGPEG
ANLFIYHLPQ	EFGDQDLLQM	FMPFGNVVSA	KVFIDKQTNL	SKCFGFVSYD
NPVSAQAAIQ	SMNGFQIGMK	RLKVQLKRSK	NDSKPY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Good P.J., Chen Q., Warner S.J., Herring D.C. (2000). A family of human RNA-binding proteins related to the Drosophila Bruno translational regulator. J. Biol. Chem. 275: 28583—28592. PMID 10893231 DOI:10.1074/jbc.M003083200
Paillard L., Legagneux V., Maniey D., Osborne H.B. (2002). c-Jun ARE targets mRNA deadenylation by an EDEN-BP (embryo deadenylation element-binding protein)-dependent pathway. J. Biol. Chem. 277: 3232—3235. PMID 11707455 DOI:10.1074/jbc.M109362200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Timchenko N.A., Welm A.L., Lu X., Timchenko L.T. (1999). CUG repeat binding protein (CUGBP1) interacts with the 5' region of C/EBPbeta mRNA and regulates translation of C/EBPbeta isoforms. Nucleic Acids Res. 27: 4517—4525. PMID 10536163 DOI:10.1093/nar/27.22.4517
Ladd A.N., Charlet-B N., Cooper T.A. (2001). The CELF family of RNA binding proteins is implicated in cell-specific and developmentally regulated alternative splicing. Mol. Cell. Biol. 21: 1285—1296. PMID 11158314 DOI:10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001
Paillard L., Legagneux V., Beverley Osborne H. (2003). A functional deadenylation assay identifies human CUG-BP as a deadenylation factor. Biol. Cell. 95: 107—113. PMID 12799066 DOI:10.1016/S0248-4900(03)00010-8