CDO1

CDO1 (англ. Cysteine dioxygenase type 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 22 972.

CDO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IC1
Ідентифікатори
Символи	CDO1, CDO-I, cysteine dioxygenase type 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603943 MGI: 105925 HomoloGene: 1365 GeneCards: CDO1
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • oxidoreductase activity • ferrous iron binding • oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen • cysteine dioxygenase activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • response to amino acid • response to glucagon • taurine biosynthetic process • cysteine metabolic process • response to glucocorticoid • response to organonitrogen compound • response to cAMP • лактація • response to ethanol • sulfur amino acid biosynthetic process • inflammatory response • L-cysteine catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1036	12583
Ensembl	ENSG00000129596	ENSMUSG00000033022
UniProt	Q16878	P60334
RefSeq (мРНК)	NM_001801 NM_001323565 NM_001323566 NM_001323567	NM_033037
RefSeq (білок)	NP_001310494 NP_001310495 NP_001310496 NP_001792	NP_149026
Локус (UCSC)	Хр. 5: 115.8 – 115.82 Mb	Хр. 18: 46.85 – 46.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQTEVLKPR		TLADLIRILH		QLFAGDEVNV		EEVQAIMEAY		ESDPTEWAMY
AKFDQYRYTR		NLVDQGNGKF		NLMILCWGEG		HGSSIHDHTN		SHCFLKMLQG
NLKETLFAWP		DKKSNEMVKK		SERVLRENQC		AYINDSIGLH		RVENISHTEP
AVSLHLYSPP		FDTCHAFDQR		TGHKNKVTMT		FHSKFGIRTP		NATSGSLENN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза.

Література

• McCann K.P., Akbari M.T., Williams A.C., Ramsden D.B. (1994). Human cysteine dioxygenase type I: primary structure derived from base sequencing of cDNA. Biochim. Biophys. Acta. 1209: 107—110. PMID 7524679 DOI:10.1016/0167-4838(94)90144-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5