CDH16

CDH16 (англ. Cadherin 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 829 амінокислот, а молекулярна маса — 89 923.

CDH16
Ідентифікатори
Символи	CDH16, cadherin 16
Зовнішні ІД	OMIM: 603118 MGI: 106671 HomoloGene: 2997 GeneCards: CDH16
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • integral component of plasma membrane • basolateral plasma membrane Біологічний процес • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1014	12556
Ensembl	ENSG00000166589	ENSMUSG00000031881
UniProt	O75309	O88338
RefSeq (мРНК)	NM_001204744 NM_001204745 NM_001204746 NM_004062	NM_001252627 NM_001252628 NM_007663
RefSeq (білок)	NP_001191673 NP_001191674 NP_001191675 NP_004053	NP_001239556 NP_001239557 NP_031689
Локус (UCSC)	Хр. 16: 66.91 – 66.92 Mb	Хр. 8: 105.33 – 105.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVPAWLWLLC		VSVPQALPKA		QPAELSVEVP		ENYGGNFPLY		LTKLPLPREG
AEGQIVLSGD		SGKATEGPFA		MDPDSGFLLV		TRALDREEQA		EYQLQVTLEM
QDGHVLWGPQ		PVLVHVKDEN		DQVPHFSQAI		YRARLSRGTR		PGIPFLFLEA
SDRDEPGTAN		SDLRFHILSQ		APAQPSPDMF		QLEPRLGALA		LSPKGSTSLD
HALERTYQLL		VQVKDMGDQA		SGHQATATVE		VSIIESTWVS		LEPIHLAENL
KVLYPHHMAQ		VHWSGGDVHY		HLESHPPGPF		EVNAEGNLYV		TRELDREAQA
EYLLQVRAQN		SHGEDYAAPL		ELHVLVMDEN		DNVPICPPRD		PTVSIPELSP
PGTEVTRLSA		EDADAPGSPN		SHVVYQLLSP		EPEDGVEGRA		FQVDPTSGSV
TLGVLPLRAG		QNILLLVLAM		DLAGAEGGFS		STCEVEVAVT		DINDHAPEFI
TSQIGPISLP		EDVEPGTLVA		MLTAIDADLE		PAFRLMDFAI		ERGDTEGTFG
LDWEPDSGHV		RLRLCKNLSY		EAAPSHEVVV		VVQSVAKLVG		PGPGPGATAT
VTVLVERVMP		PPKLDQESYE		ASVPISAPAG		SFLLTIQPSD		PISRTLRFSL
VNDSEGWLCI		EKFSGEVHTA		QSLQGAQPGD		TYTVLVEAQD		TDEPRLSASA
PLVIHFLKAP		PAPALTLAPV		PSQYLCTPRQ		DHGLIVSGPS		KDPDLASGHG
PYSFTLGPNP		TVQRDWRLQT		LNGSHAYLTL		ALHWVEPREH		IIPVVVSHNA
QMWQLLVRVI		VCRCNVEGQC		MRKVGRMKGM		PTKLSAVGIL		VGTLVAIGIF
LILIFTHWTM		SRKKDPDQPA		DSVPLKATV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16