CD40

CD40 (англ. CD40 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 30 619.

CD40
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CZZ, 1D00, 1FLL, 1LB6, 3QD6, 5DMJ, 5IHL, 5DMI
Ідентифікатори
Символи	CD40, Bp50, CDW40, TNFRSF5, p50, CD40 (protein), CD40 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 109535 MGI: 88336 HomoloGene: 954 GeneCards: CD40
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, CD40 deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • enzyme binding • ubiquitin protein ligase binding • protein domain specific binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • cell surface • CD40 receptor complex • екзосома • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • soma • varicosity Біологічний процес • positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of MAP kinase activity • positive regulation of interleukin-12 production • protein kinase B signaling • positive regulation of protein kinase C signaling • процес імунної системи • cellular calcium ion homeostasis • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway • platelet activation • multicellular organism development • B cell activation • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • response to lipopolysaccharide • B cell proliferation • cellular response to mechanical stimulus • positive regulation of endothelial cell apoptotic process • regulation of cell population proliferation • positive regulation of B cell proliferation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • defense response to virus • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of immune response • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • apoptotic signaling pathway • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • cellular response to lipopolysaccharide • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • defense response to protozoan • response to bacterium • response to nutrient levels • response to cobalamin • response to interferon-gamma • cellular response to erythropoietin • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • response to peptide • inflammatory response • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	958	21939
Ensembl	ENSG00000101017	ENSMUSG00000017652
UniProt	P25942	P27512
RefSeq (мРНК)	NM_001250 NM_001302753 NM_152854 NM_001322421 NM_001322422 NM_001362758	NM_011611 NM_170702 NM_170703 NM_170704
RefSeq (білок)	NP_001241 NP_001289682 NP_001309350 NP_001309351 NP_690593 NP_001349687	NP_035741 NP_733803 NP_733804 NP_733805
Локус (UCSC)	Хр. 20: 46.12 – 46.13 Mb	Хр. 2: 164.9 – 164.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRLPLQCVL		WGCLLTAVHP		EPPTACREKQ		YLINSQCCSL		CQPGQKLVSD
CTEFTETECL		PCGESEFLDT		WNRETHCHQH		KYCDPNLGLR		VQQKGTSETD
TICTCEEGWH		CTSEACESCV		LHRSCSPGFG		VKQIATGVSD		TICEPCPVGF
FSNVSSAFEK		CHPWTSCETK		DLVVQQAGTN		KTDVVCGPQD		RLRALVVIPI
IFGILFAILL		VLVFIKKVAK		KPTNKAPHPK		QEPQEINFPD		DLPGSNTAAP
VQETLHGCQP		VTQEDGKESR		ISVQERQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Tone M., Tone Y., Fairchild P.J., Wykes M., Waldmann H. (2001). Regulation of CD40 function by its isoforms generated through alternative splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1751—1756. PMID 11172023 DOI:10.1073/pnas.98.4.1751
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40. FEBS Lett. 358: 113—118. PMID 7530216 DOI:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
• Bajorath J., Aruffo A. (1997). Construction and analysis of a detailed three-dimensional model of the ligand binding domain of the human B cell receptor CD40. Proteins. 27: 59—70. PMID 9037712 DOI:10.1002/(SICI)1097-0134(199701)27:1<59::AID-PROT7>3.3.CO;2-Z
• Stamenkovic I., Clark E.A., Seed B. (1989). A B-lymphocyte activation molecule related to the nerve growth factor receptor and induced by cytokines in carcinomas. EMBO J. 8: 1403—1410. PMID 2475341

Див. також

• Хромосома 20