CD1D

CD1D
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4WO4, 1ZT4, 2PO6, 3HUJ, 3SDX, 3TZV, 3U0P, 3VWJ, 3VWK, 4EN3, 4LHU, 4MNG, 4MQ7, 4WW2
Ідентифікатори
Символи	CD1D, CD1A, R3, R3G1, CD1d molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 188410 MGI: 107674 HomoloGene: 1337 GeneCards: CD1D
Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-2-microglobulin binding; • ліпопептидний зв'язок; • GO:0031493 histone binding; • endogenous lipid antigen binding; • lipid antigen binding; • exogenous lipid antigen binding; • cell adhesion molecule binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • ендосома; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • lysosomal membrane; • basolateral plasma membrane; • лізосома; • endosome membrane; • клітинна мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • міжклітинний простір; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• процес імунної системи; • T cell selection; • heterotypic cell-cell adhesion; • positive regulation of T cell proliferation; • detection of bacterium; • positive regulation of innate immune response; • antigen processing and presentation, exogenous lipid antigen via MHC class Ib; • вроджений імунітет; • GO:0022415 viral process; • antigen processing and presentation, endogenous lipid antigen via MHC class Ib; • regulation of immune response; • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	912
	12479
	ENSG00000158473
	ENSMUSG00000028076
	P15813
	P11609
	NM_001766; NM_001319145; NM_001371761; NM_001371762; NM_001371763
	NM_007639; NM_001379501; NM_001379502; NM_001379503
	NP_001306074; NP_001757; NP_001358690; NP_001358691; NP_001358692
	NP_031665; NP_001366430; NP_001366431; NP_001366432
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD1D (англ. CD1d molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 717^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGCLLFLLLW	ALLQAWGSAE	VPQRLFPLRC	LQISSFANSS	WTRTDGLAWL
GELQTHSWSN	DSDTVRSLKP	WSQGTFSDQQ	WETLQHIFRV	YRSSFTRDVK
EFAKMLRLSY	PLELQVSAGC	EVHPGNASNN	FFHVAFQGKD	ILSFQGTSWE
PTQEAPLWVN	LAIQVLNQDK	WTRETVQWLL	NGTCPQFVSG	LLESGKSELK
KQVKPKAWLS	RGPSPGPGRL	LLVCHVSGFY	PKPVWVKWMR	GEQEQQGTQP
GDILPNADET	WYLRATLDVV	AGEAAGLSCR	VKHSSLEGQD	IVLYWGGSYT
SMGLIALAVL	ACLLFLLIVG	FTSRFKRQTS	YQGVL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, ендосомах.

Література

Calabi F., Jarvis J.M., Martin L., Milstein C. (1989). Two classes of CD1 genes. Eur. J. Immunol. 19: 285—292. PMID 2467814 DOI:10.1002/eji.1830190211
Balk S.P., Bleicher P.A., Terhorst C. (1989). Isolation and characterization of a cDNA and gene coding for a fourth CD1 molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 252—256. PMID 2463622 DOI:10.1073/pnas.86.1.252
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Han M., Hannick L.I., DiBrino M., Robinson M.A. (1999). Polymorphism of human CD1 genes. Tissue Antigens. 54: 122—127. PMID 10488738 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.540202.x
Martin L.H., Calabi F., Milstein C. (1986). Isolation of CD1 genes: a family of major histocompatibility complex-related differentiation antigens. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 9154—9158. PMID 3097645 DOI:10.1073/pnas.83.23.9154
Kang S.-J., Cresswell P. (2002). Regulation of intracellular trafficking of human CD1d by association with MHC class II molecules. EMBO J. 21: 1650—1660. PMID 11927549 DOI:10.1093/emboj/21.7.1650

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1637 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P15813 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1637 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P15813 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]