CD163L1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
CD163L1 (англ. CD163 molecule like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 453 амінокислот, а молекулярна маса — 159 239[3].
CD163L1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CD163L1, CD163B, M160, SCARI2, CD163 molecule like 1, WC1, STAR | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606079 HomoloGene: 138426 GeneCards: CD163L1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 7.35 – 7.48 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | н/д | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MMLPQNSWHI | DFGRCCCHQN | LFSAVVTCIL | LLNSCFLISS | FNGTDLELRL | ||||
VNGDGPCSGT | VEVKFQGQWG | TVCDDGWNTT | ASTVVCKQLG | CPFSFAMFRF | ||||
GQAVTRHGKI | WLDDVSCYGN | ESALWECQHR | EWGSHNCYHG | EDVGVNCYGE | ||||
ANLGLRLVDG | NNSCSGRVEV | KFQERWGTIC | DDGWNLNTAA | VVCRQLGCPS | ||||
SFISSGVVNS | PAVLRPIWLD | DILCQGNELA | LWNCRHRGWG | NHDCSHNEDV | ||||
TLTCYDSSDL | ELRLVGGTNR | CMGRVELKIQ | GRWGTVCHHK | WNNAAADVVC | ||||
KQLGCGTALH | FAGLPHLQSG | SDVVWLDGVS | CSGNESFLWD | CRHSGTVNFD | ||||
CLHQNDVSVI | CSDGADLELR | LADGSNNCSG | RVEVRIHEQW | WTICDQNWKN | ||||
EQALVVCKQL | GCPFSVFGSR | RAKPSNEARD | IWINSISCTG | NESALWDCTY | ||||
DGKAKRTCFR | RSDAGVICSD | KADLDLRLVG | AHSPCYGRLE | VKYQGEWGTV | ||||
CHDRWSTRNA | AVVCKQLGCG | KPLHVFGMTY | FKEASGPIWL | DDVSCIGNES | ||||
NIWDCEHSGW | GKHNCVHRED | VIVTCSGDAT | WGLRLVGGSN | RCSGRLEVYF | ||||
QGRWGTVCDD | GWNSKAAAVV | CSQLDCPSSI | IGMGLGNAST | GYGKIWLDDV | ||||
SCDGDESDLW | SCRNSGWGNN | DCSHSEDVGV | ICSDASDMEL | RLVGGSSRCA | ||||
GKVEVNVQGA | VGILCANGWG | MNIAEVVCRQ | LECGSAIRVS | REPHFTERTL | ||||
HILMSNSGCT | GGEASLWDCI | RWEWKQTACH | LNMEASLICS | AHRQPRLVGA | ||||
DMPCSGRVEV | KHADTWRSVC | DSDFSLHAAN | VLCRELNCGD | AISLSVGDHF | ||||
GKGNGLTWAE | KFQCEGSETH | LALCPIVQHP | EDTCIHSREV | GVVCSRYTDV | ||||
RLVNGKSQCD | GQVEINVLGH | WGSLCDTHWD | PEDARVLCRQ | LSCGTALSTT | ||||
GGKYIGERSV | RVWGHRFHCL | GNESLLDNCQ | MTVLGAPPCI | HGNTVSVICT | ||||
GSLTQPLFPC | LANVSDPYLS | AVPEGSALIC | LEDKRLRLVD | GDSRCAGRVE | ||||
IYHDGFWGTI | CDDGWDLSDA | HVVCQKLGCG | VAFNATVSAH | FGEGSGPIWL | ||||
DDLNCTGMES | HLWQCPSRGW | GQHDCRHKED | AGVICSEFTA | LRLYSETETE | ||||
SCAGRLEVFY | NGTWGSVGRR | NITTAIAGIV | CRQLGCGENG | VVSLAPLSKT | ||||
GSGFMWVDDI | QCPKTHISIW | QCLSAPWERR | ISSPAEETWI | TCEDRIRVRG | ||||
GDTECSGRVE | IWHAGSWGTV | CDDSWDLAEA | EVVCQQLGCG | SALAALRDAS | ||||
FGQGTGTIWL | DDMRCKGNES | FLWDCHAKPW | GQSDCGHKED | AGVRCSGQSL | ||||
KSLNASSGHL | ALILSSIFGL | LLLVLFILFL | TWCRVQKQKH | LPLRVSTRRR | ||||
GSLEENLFHE | METCLKREDP | HGTRTSDDTP | NHGCEDASDT | SLLGVLPASE | ||||
ATK |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
ред.- Groenlund J., Vitved L., Lausen M., Skjoedt K., Holmskov U. (2000). Cloning of a novel scavenger receptor cysteine-rich type I transmembrane molecule (M160) expressed by human macrophages. J. Immunol. 165: 6406—6415. PMID 11086079 DOI:10.4049/jimmunol.165.11.6406
- Van Gorp H., Van Breedam W., Van Doorsselaere J., Delputte P.L., Nauwynck H.J. (2010). Identification of the CD163 protein domains involved in infection of the porcine reproductive and respiratory syndrome virus. J. Virol. 84: 3101—3105. PMID 20032174 DOI:10.1128/JVI.02093-09
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30375 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NR16 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |