CCM2L

CCM2L (англ. CCM2 like scaffolding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 571 амінокислот, а молекулярна маса — 62 179.

CCM2L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4FQN, 4TVQ, 4WJ7, 4Y5O, 4YKC, 4YKD, 4YL6
Ідентифікатори
Символи	CCM2L, C20orf160, dJ310O13.5, CCM2 like scaffolding protein, CCM2 like scaffold protein
Зовнішні ІД	MGI: 2385159 HomoloGene: 130991 GeneCards: CCM2L
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • компонент клітини Біологічний процес • negative regulation of homotypic cell-cell adhesion • positive regulation of fibroblast growth factor production • cardiac atrium morphogenesis • Загоєння ран • negative regulation of protein binding • cardiac muscle tissue growth • ventricular trabecula myocardium morphogenesis • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140706	228788
Ensembl	ENSG00000101331	ENSMUSG00000027474
UniProt	Q9NUG4	Q8VCC6
RefSeq (мРНК)	NM_080625 NM_001365692	NM_145536 NM_001372363
RefSeq (білок)	NP_542192 NP_001352621	NP_663511
Локус (UCSC)	Хр. 20: 32.01 – 32.03 Mb	Хр. 2: 152.91 – 152.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEYEVKKGKK		GFVSPIRRLV		FPKAGRRAAC		RSSVSRRPLH		SMPLYPPDYL
IDPQILLCDY		LEKEVKFLGH		LTWVTSSLNP		SSRDELLQLL		DTARQLKELP
LKTTAEQDSI		LSLSARCLLL		TWRDNEELIL		RIPTHEIAAA		SYLQDDALHL
LVLKTGLGVD		PVPAGVDASP		GGAGRDPGPP		GGAPEKRRVG		TAERRHTICS
LDWRMGWGGG		AAEARAGGGG		GGSLERQRAG		ARASGSWERR		QTFSGSWERR
HGGGGGGGGA		GKPGGSWERR		QAGSGGGGSW		ERRHPGPNPL		DPQDPSPDAY
CNLVILAVAN		RDAAEESCAL		ICQVFQIIYG		DQSIECVDRA		GYHYTSTPER
PWLCSRSESC		HTDGTYAYDA		DFSCCSSFNG		SQDTFEACYS		GTSTPSFHGS
HCSGSDHSSL		GLEQLQDYMV		TLRSKLGPLE		IQQFAMLLRE		YRLGLPIQDY
CTGLLKLYGD		RRKFLLLGMR		PFIPDQDIGY		FEGFLEGVGI		REGGILTDSF
GRIKRSMSST		SASAVRSYDG		AAQRPEAQAF		HRLLADITHD		IEALAPDDDD
DDEDEPRGSR		GGSDAAEDNY		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20