CCDC88A

CCDC88A (англ. Coiled-coil domain containing 88A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 871 амінокислот, а молекулярна маса — 216 042.

CCDC88A
Ідентифікатори
Символи	CCDC88A, APE, GIRDIN, GIV, GRDN, HkRP1, KIAA1212, coiled-coil domain containing 88A, PEHO, PEHOL
Зовнішні ІД	OMIM: 609736 MGI: 1925177 HomoloGene: 41180 GeneCards: CCDC88A
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • phosphatidylinositol binding • actin binding • microtubule binding • protein kinase B binding • dynein light intermediate chain binding • G-protein gamma-subunit binding Клітинна компонента • цитоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • ендоплазматичний ретикулум • lamellipodium • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell leading edge • центросома • Центріоль • цитоскелет • ciliary basal body • COPI-coated Golgi to ER transport vesicle Біологічний процес • regulation of actin cytoskeleton organization • нейробіологія розвитку • реплікація ДНК • membrane organization • cell migration • lamellipodium assembly • activation of protein kinase B activity • regulation of DNA replication • TOR signaling • regulation of protein phosphorylation • regulation of cell population proliferation • regulation of neuron projection development • cell projection organization • cytoskeleton-dependent intracellular transport • cytoplasmic microtubule organization • positive regulation of cilium assembly • positive regulation of protein localization to cilium Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55704	108686
Ensembl	ENSG00000115355	ENSMUSG00000032740
UniProt	Q3V6T2	Q5SNZ0
RefSeq (мРНК)	NM_001135597 NM_001254943 NM_018084 NM_001365480	NM_176841 NM_001363368 NM_001363369
RefSeq (білок)	NP_001129069 NP_001241872 NP_060554 NP_001352409	NP_789811 NP_001350297 NP_001350298
Локус (UCSC)	Хр. 2: 55.29 – 55.42 Mb	Хр. 11: 29.32 – 29.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENEIFTPLL		EQFMTSPLVT		WVKTFGPLAA		GNGTNLDEYV		ALVDGVFLNQ
VMLQINPKLE		SQRVNKKVNN		DASLRMHNLS		ILVRQIKFYY		QETLQQLIMM
SLPNVLIIGK		NPFSEQGTEE		VKKLLLLLLG		CAVQCQKKEE		FIERIQGLDF
DTKAAVAAHI		QEVTHNQENV		FDLQWMEVTD		MSQEDIEPLL		KNMALHLKRL
IDERDEHSET		IIELSEERDG		LHFLPHASSS		AQSPCGSPGM		KRTESRQHLS
VELADAKAKI		RRLRQELEEK		TEQLLDCKQE		LEQMEIELKR		LQQENMNLLS
DARSARMYRD		ELDALREKAV		RVDKLESEVS		RYKERLHDIE		FYKARVEELK
EDNQVLLETK		TMLEDQLEGT		RARSDKLHEL		EKENLQLKAK		LHDMEMERDM
DRKKIEELME		ENMTLEMAQK		QSMDESLHLG		WELEQISRTS		ELSEAPQKSL
GHEVNELTSS		RLLKLEMENQ		SLTKTVEELR		TTVDSVEGNA		SKILKMEKEN
QRLSKKVEIL		ENEIVQEKQS		LQNCQNLSKD		LMKEKAQLEK		TIETLRENSE
RQIKILEQEN		EHLNQTVSSL		RQRSQISAEA		RVKDIEKENK		ILHESIKETS
SKLSKIEFEK		RQIKKELEHY		KEKGERAEEL		ENELHHLEKE		NELLQKKITN
LKITCEKIEA		LEQENSELER		ENRKLKKTLD		SFKNLTFQLE		SLEKENSQLD
EENLELRRNV		ESLKCASMKM		AQLQLENKEL		ESEKEQLKKG		LELLKASFKK
TERLEVSYQG		LDIENQRLQK		TLENSNKKIQ		QLESELQDLE		MENQTLQKNL
EELKISSKRL		EQLEKENKSL		EQETSQLEKD		KKQLEKENKR		LRQQAEIKDT
TLEENNVKIG		NLEKENKTLS		KEIGIYKESC		VRLKELEKEN		KELVKRATID
IKTLVTLRED		LVSEKLKTQQ		MNNDLEKLTH		ELEKIGLNKE		RLLHDEQSTD
DSRYKLLESK		LESTLKKSLE		IKEEKIAALE		ARLEESTNYN		QQLRQELKTV
KKNYEALKQR		QDEERMVQSS		PPISGEDNKW		ERESQETTRE		LLKVKDRLIE
VERNNATLQA		EKQALKTQLK		QLETQNNNLQ		AQILALQRQT		VSLQEQNTTL
QTQNAKLQVE		NSTLNSQSTS		LMNQNAQLLI		QQSSLENENE		SVIKEREDLK
SLYDSLIKDH		EKLELLHERQ		ASEYESLISK		HGTLKSAHKN		LEVEHRDLED
RYNQLLKQKG		QLEDLEKMLK		VEQEKMLLEN		KNHETVAAEY		KKLCGENDRL
NHTYSQLLKE		TEVLQTDHKN		LKSLLNNSKL		EQTRLEAEFS		KLKEQYQQLD
ITSTKLNNQC		ELLSQLKGNL		EEENRHLLDQ		IQTLMLQNRT		LLEQNMESKD
LFHVEQRQYI		DKLNELRRQK		EKLEEKIMDQ		YKFYDPSPPR		RRGNWITLKM
RKLIKSKKDI		NRERQKSLTL		TPTRSDSSEG		FLQLPHQDSQ		DSSSVGSNSL
EDGQTLGTKK		SSMVALKRLP		FLRNRPKDKD		KMKACYRRSM		SMNDLVQSMV
LAGQWTGSTE		NLEVPDDIST		GKRRKELGAM		AFSTTAINFS		TVNSSAGFRS
KQLVNNKDTT		SFEDISPQGV		SDDSSTGSRV		HASRPASLDS		GRTSTSNSNN
NASLHEVKAG		AVNNQSRPQS		HSSGEFSLLH		DHEAWSSSGS		SPIQYLKRQT
RSSPVLQHKI		SETLESRHHK		IKTGSPGSEV		VTLQQFLEES		NKLTSVQIKS
SSQENLLDEV		MKSLSVSSDF		LGKDKPVSCG		LARSVSGKTP		GDFYDRRTTK
PEFLRPGPRK		TEDTYFISSA		GKPTPGTQGK		IKLVKESSLS		RQSKDSNPYA
TLPRASSVIS		TAEGTTRRTS		IHDFLTKDSR		LPISVDSPPA		AADSNTTAAS
NVDKVQESRN		SKSRSREQQS		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біогенез та деградація війок, реплікація ДНК, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Le-Niculescu H., Niesman I., Fischer T., DeVries L., Farquhar M.G. (2005). Identification and characterization of GIV, a novel Galpha i/s-interacting protein found on COPI, endoplasmic reticulum-Golgi transport vesicles. J. Biol. Chem. 280: 22012—22020. PMID 15749703 DOI:10.1074/jbc.M501833200
• Enomoto A., Ping J., Takahashi M. (2006). Girdin, a novel actin-binding protein, and its family of proteins possess versatile functions in the Akt and Wnt signaling pathways. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1086: 169—184. PMID 17185515 DOI:10.1196/annals.1377.016

Див. також

• Хромосома 2