CCDC36

CCDC36 (англ. Coiled-coil domain containing 36) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 66 343.

CCDC36
Ідентифікатори
Символи	IHO1, CT74, coiled-coil domain containing 36, LELA1, interactor of HORMAD1 1, CCDC36
Зовнішні ІД	MGI: 3612242 HomoloGene: 52256 GeneCards: IHO1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • хромосома • condensed nuclear chromosome Біологічний процес • DNA recombination • диференціація клітин • GO:0007126 мейоз • homologous chromosome pairing at meiosis • Сперматогенез • meiotic DNA double-strand break formation • Оогенез • regulation of homologous chromosome segregation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	339834	434438
Ensembl	ENSG00000173421	ENSMUSG00000047220
UniProt	Q8IYA8	Q6PDM4
RefSeq (мРНК)	NM_001135197 NM_178173	NM_001135198 NM_001379658
RefSeq (білок)	NP_001128669 NP_835467	NP_001128670 NP_001366587
Локус (UCSC)	Хр. 3: 49.2 – 49.26 Mb	Хр. 9: 108.28 – 108.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNFNVWNIKE		MLSIPSGSGN		KKSSNWNNNQ		NDYSSLSDSQ		FLFGSQFCPE
NSETLSAPLD		FGAHLRHSKQ		SQQNYLEGEP		SIFTKYQTKP		QLFGGDIKDG
GLFPPPLSVG		KSKGLLEQFE		EKKKRAKDKC		DSETLYNFVS		NVRESILRLQ
TSVEKSEDHL		SSRSQSILDS		LETVAKTLQE		TIQAQNDLVF		EAVQDKGNME
QAILEMKKRF		EARQGEFIEM		KSNLKHLEVL		VAQQSQEFQQ		LCEQLGQLNV
PSVLAELKRL		ISVPPVKDSA		SQTSPPLAQS		LNLTRQEKYT		SEKPVLWQAQ
ALPAAWNPGM		GSLQPGEFDV		WGEGAKNDDL		QEEAALPAFG		SHERNRHVKD
KVVQTNCKNW		AVTKTGAKNH		GSSVPGHKIP		SDRDLVSQGA		SQLTSLEINF
STSIKNACQK		YQAQSMFLCD		PREHLVIKQK		DGTVEMRGKD		KKQQPRKAHR
AHRGRLIASK		QKQIPIQTCK		FNSKYQSPQP		AISVPQSPFL		GQQEPRAQPL
HLQCPRSPRK		PVCPILGGTV		MPNKTVRAVQ		GRLLQLSRCS		SQDNWLLSSS
SQGDHQMSWF		SDLNLGCSET		PLCKEAGKNL		LYDLGFDSSD		DDGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як рекомбінація ДНК, диференціація клітин, сперматогенез, мейоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3