CCDC178

CCDC178 (англ. Coiled-coil domain containing 178) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 867 амінокислот, а молекулярна маса — 102 011.

CCDC178
Ідентифікатори
Символи	CCDC178, C18orf34, coiled-coil domain containing 178
Зовнішні ІД	MGI: 1918200 HomoloGene: 12373 GeneCards: CCDC178
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	374864	70950
Ensembl	ENSG00000166960	ENSMUSG00000024306
UniProt	Q5BJE1	Q8CDV0
RefSeq (мРНК)	NM_001105528 NM_001308126 NM_198995 NM_001371120 NM_001371121	NM_027616
RefSeq (білок)	NP_001098998 NP_001295055 NP_945346 NP_001358049 NP_001358050	NP_081892
Локус (UCSC)	Хр. 18: 32.94 – 33.44 Mb	Хр. 18: 21.94 – 22.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTENKTVSSS		STRDDQTNIG		LTCQEVKALR		EKAWSRTNEG		NAMSQSLVLY
GASKENSEGF		HESKMTNTEG		VNKGIYFSYP		CRRHSCAVVN		IPAPCVNKMI
SHIQDVESKI		QEHLKRFETS		FEEWSRTSST		KDLKEDWSVT		TPVKEVKPGE
KRDEKCPELK		QEMETLLSEA		IRLIKSLETD		RADAEEALKQ		QRSRKNMINM
KIDSWSVWKL		QELPLAVQKE		HEAYLSDVIE		LQWHLEDKAN		QLQHFEKQKT
ELEEANAKIQ		ADIDYMNEHG		PLLDSKQNQE		LQDLKNHYKK		KMEVMDLHRK
VNEELEEALE		ACENARLKAQ		QIKEEIDKDI		YQDEKTIEAY		KREIYQLNSL
FDHYSSSVIN		VNTNIEEKEE		EVTEAIRETK		SSKNELHSLS		KMLEDLRRVY
DQLTWKQKSH		ENQYLEAVND		FYAAKKTWDI		ELSDVAKDFS		AISLACTKLT
EDNKKLEIDI		NKITVKTNES		IRKKSKYESE		IKYLTIMKLK		NDKHLKNIYK
EAYRIGTLFH		LTKHKTDEME		DKIAEVRRKF		KGREEFLKKL		TQGEVAAGMV
LQKKLYSIYE		VQALERKELI		KNRAICAMSL		AELQEPLLQL		EDEAERIRSL
DKEHSVMLNN		IIDQKDLIRR		KVGKVKKKLR		KKGKKTLDAL		IETESKRSAI
FKDLEATKSK		TMIFYAKINE		LNEELKAKEE		EKKSFDQTLE		ILKNKFITMR
FKREHAQTVF		DHYMQEKKDC		EERIFEEDQR		FRVLLAVRQK		TLQDTQKIIA
DSLEENLRLA		QEYQQLQITF		LKEKDNYFNI		YDKQLSLDTS		IRDKKQLCQL
QRRMHTLWQE		HFKLVVLFSQ		MRLANFQTDS		QESIQKILAV		QEESSNLMQH
ILGFFQTLTD		GTCENDG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 18