CBX4

CBX4 (англ. Chromobox 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 560 амінокислот, а молекулярна маса — 61 368.

CBX4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K28, 3I8Z, 5EPL
Ідентифікатори
Символи	CBX4, NBP16, PC2, chromobox 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603079 MGI: 1195985 HomoloGene: 2712 GeneCards: CBX4
Онтологія гена Молекулярна функція • SUMO transferase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • chromatin binding • SUMO binding • methylated histone binding • phosphoprotein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • enzyme binding • transferase activity Клітинна компонента • nuclear speck • PRC1 complex • PcG protein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • protein sumoylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8535	12418
Ensembl	ENSG00000141582	ENSMUSG00000039989
UniProt	O00257	O55187
RefSeq (мРНК)	NM_003655	NM_007625
RefSeq (білок)	NP_003646	NP_031651
Локус (UCSC)	Хр. 17: 79.83 – 79.84 Mb	Хр. 11: 118.97 – 118.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELPAVGEHV		FAVESIEKKR		IRKGRVEYLV		KWRGWSPKYN		TWEPEENILD
PRLLIAFQNR		ERQEQLMGYR		KRGPKPKPLV		VQVPTFARRS		NVLTGLQDSS
TDNRAKLDLG		AQGKGQGHQY		ELNSKKHHQY		QPHSKERAGK		PPPPGKSGKY
YYQLNSKKHH		PYQPDPKMYD		LQYQGGHKEA		PSPTCPDLGA		KSHPPDKWAQ
GAGAKGYLGA		VKPLAGAAGA		PGKGSEKGPP		NGMMPAPKEA		VTGNGIGGKM
KIVKNKNKNG		RIVIVMSKYM		ENGMQAVKIK		SGEVAEGEAR		SPSHKKRAAD
ERHPPADRTF		KKAAGAEEKK		VEAPPKRREE		EVSGVSDPQP		QDAGSRKLSP
TKEAFGEQPL		QLTTKPDLLA		WDPARNTHPP		SHHPHPHPHH		HHHHHHHHHH
AVGLNLSHVR		KRCLSETHGE		REPCKKRLTA		RSISTPTCLG		GSPAAERPAD
LPPAAALPQP		EVILLDSDLD		EPIDLRCVKT		RSEAGEPPSS		LQVKPETPAS
AAVAVAAAAA		PTTTAEKPPA		EAQDEPAESL		SEFKPFFGNI		IITDVTANCL
TVTFKEYVTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, лігаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Salichs E., Ledda A., Mularoni L., Alba M.M., de la Luna S. (2009). Genome-wide analysis of histidine repeats reveals their role in the localization of human proteins to the nuclear speckles compartment. PLoS Genet. 5: E1000397—E1000397. PMID 19266028 DOI:10.1371/journal.pgen.1000397
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kagey M.H., Melhuish T.A., Wotton D. (2003). The polycomb protein Pc2 is a SUMO E3. Cell. 113: 127—137. PMID 12679040 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00159-4
• Kagey M.H., Melhuish T.A., Powers S.E., Wotton D. (2005). Multiple activities contribute to Pc2 E3 function. EMBO J. 24: 108—119. PMID 15592428 DOI:10.1038/sj.emboj.7600506
• Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
• Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Див. також

• Хромосома 17