CBX3

CBX3 (англ. Chromobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 183 амінокислот, а молекулярна маса — 20 811.

CBX3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3TZD, 2L11, 3DM1, 3KUP
Ідентифікатори
Символи	CBX3, HECH, HP1-GAMMA, HP1Hs-gamma, chromobox 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604477 MGI: 108515 HomoloGene: 40583 GeneCards: CBX3
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • histone methyltransferase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding Клітинна компонента • nuclear envelope • веретено поділу • nuclear inner membrane • Хроматин • центромера • клітинне ядро • condensed chromosome, centromeric region • нуклеоплазма • site of DNA damage • senescence-associated heterochromatin focus Біологічний процес • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to dexamethasone stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11335	12417
Ensembl	ENSG00000122565	ENSMUSG00000029836
UniProt	Q13185	P23198
RefSeq (мРНК)	NM_007276 NM_016587	NM_001037798 NM_007624 NM_001355002
RefSeq (білок)	NP_009207 NP_057671	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 26.2 – 26.21 Mb	Хр. 6: 51.45 – 51.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASNKTTLQK		MGKKQNGKSK		KVEEAEPEEF		VVEKVLDRRV		VNGKVEYFLK
WKGFTDADNT		WEPEENLDCP		ELIEAFLNSQ		KAGKEKDGTK		RKSLSDSESD
DSKSKKKRDA		ADKPRGFARG		LDPERIIGAT		DSSGELMFLM		KWKDSDEADL
VLAKEANMKC		PQIVIAFYEE		RLTWHSCPED		EAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Локалізований у ядрі.

Література

• Ye Q., Worman H.J. (1996). Interaction between an integral protein of the nuclear envelope inner membrane and human chromodomain proteins homologous to Drosophila HP1. J. Biol. Chem. 271: 14653—14656. PMID 8663349 DOI:10.1074/jbc.271.25.14653
• Koike N., Maita H., Taira T., Ariga H., Iguchi-Ariga S.M.M. (2000). Identification of heterochromatin protein 1 (HP1) as a phosphorylation target by Pim-1 kinase and the effect of phosphorylation on the transcriptional repression function of HP1. FEBS Lett. 467: 17—21. PMID 10664448 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01105-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ye Q., Callebaut I., Pezhman A., Courvalin J.-C., Worman H.J. (1997). Domain-specific interactions of human HP1-type chromodomain proteins and inner nuclear membrane protein LBR. J. Biol. Chem. 272: 14983—14989. PMID 9169472 DOI:10.1074/jbc.272.23.14983
• Ainsztein A.M., Kandels-Lewis S.E., Mackay A.M., Earnshaw W.C. (1998). INCENP centromere and spindle targeting: identification of essential conserved motifs and involvement of heterochromatin protein HP1. J. Cell Biol. 143: 1763—1774. PMID 9864353 DOI:10.1083/jcb.143.7.1763
• Seeler J.-S., Marchio A., Sitterlin D., Transy C., Dejean A. (1998). Interaction of SP100 with HP1 proteins: a link between the promyelocytic leukemia-associated nuclear bodies and the chromatin compartment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 7316—7321. PMID 9636146 DOI:10.1073/pnas.95.13.7316

Див. також

• Хромосома 7