CAVIN1

CAVIN1
Ідентифікатори
Символи	CAVIN1, CAVIN, CGL4, cavin-1, FKSG13, PTRF, polymerase I and transcript release factor, caveolae associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603198 MGI: 1277968 HomoloGene: 7499 GeneCards: CAVIN1
Пов'язані генетичні захворювання
	congenital generalized lipodystrophy type 4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• rRNA binding; • rRNA primary transcript binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • нуклеоплазма; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія; • caveola; • membrane raft; • клітинне ядро; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • DNA-templated transcription, termination; • transcription, DNA-templated; • rRNA transcription; • positive regulation of cell motility; • protein secretion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	284119
	19285
	ENSG00000177469
	ENSMUSG00000004044
	Q6NZI2
	O54724
	NM_012232
	NM_008986; NM_001359105; NM_027160
	NP_036364
	NP_033012; NP_001346034
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CAVIN1 (англ. Caveolae associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 476^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDPTLYIVE	RPLPGYPDAE	APEPSSAGAQ	AAEEPSGAGS	EELIKSDQVN
GVLVLSLLDK	IIGAVDQIQL	TQAQLEERQA	EMEGAVQSIQ	GELSKLGKAH
ATTSNTVSKL	LEKVRKVSVN	VKTVRGSLER	QAGQIKKLEV	NEAELLRRRN
FKVMIYQDEV	KLPAKLSISK	SLKESEALPE	KEGEELGEGE	RPEEDAAALE
LSSDEAVEVE	EVIEESRAER	IKRSGLRRVD	DFKKAFSKEK	MEKTKVRTRE
NLEKTRLKTK	ENLEKTRHTL	EKRMNKLGTR	LVPAERREKL	KTSRDKLRKS
FTPDHVVYAR	SKTAVYKVPP	FTFHVKKIRE	GQVEVLKATE	MVEVGADDDE
GGAERGEAGD	LRRGSSPDVH	ALLEITEESD	AVLVDKSDSD

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jansa P., Mason S.W., Hoffmann-Rohrer U., Grummt I. (1998). Cloning and functional characterization of PTRF, a novel protein which induces dissociation of paused ternary transcription complexes. EMBO J. 17: 2855—2864. PMID 9582279 DOI:10.1093/emboj/17.10.2855
Aboulaich N., Vainonen J.P., Stralfors P., Vener A.V. (2004). Vectorial proteomics reveal targeting, phosphorylation and specific fragmentation of polymerase I and transcript release factor (PTRF) at the surface of caveolae in human adipocytes. Biochem. J. 383: 237—248. PMID 15242332 DOI:10.1042/BJ20040647
Aboulaich N., Oertegren U., Vener A.V., Stralfors P. (2006). Association and insulin regulated translocation of hormone-sensitive lipase with PTRF. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 657—661. PMID 17026959 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.094
Liu L., Pilch P.F. (2008). A critical role of cavin (polymerase I and transcript release factor) in caveolae formation and organization. J. Biol. Chem. 283: 4314—4322. PMID 18056712 DOI:10.1074/jbc.M707890200
Hansen C.G., Bright N.A., Howard G., Nichols B.J. (2009). SDPR induces membrane curvature and functions in the formation of caveolae. Nat. Cell Biol. 11: 807—814. PMID 19525939 DOI:10.1038/ncb1887