CATSPERE

CATSPERE (англ. Catsper channel auxiliary subunit epsilon) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 951 амінокислот, а молекулярна маса — 109 662.

CATSPERE
Ідентифікатори
Символи	CATSPERE, C1orf101, catsper channel auxiliary subunit epsilon, C10orf101
Зовнішні ІД	OMIM: 617510 MGI: 3647531 HomoloGene: 52161 GeneCards: CATSPERE
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	257044	631584
Ensembl	ENSG00000179397	ENSMUSG00000102483
UniProt	Q5SY80	P0DP43
RefSeq (мРНК)	NM_001130957 NM_001242340 NM_173807	NM_001368823
RefSeq (білок)	NP_001124429 NP_001229269 NP_776168	XP_006497146 XP_006497147 XP_006497148 XP_006497150 XP_017169520 XP_017169522
Локус (UCSC)	Хр. 1: 244.45 – 244.64 Mb	Хр. 1: 177.64 – 177.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAREVAVLL		LWLSCYGSAL		WRYSTNSPNY		RIFSTRSTIK		LEYEGTLFTE
WSVPETCFVL		NKSSPTTELR		CSSPGVHAIK		PIVTGPDEEE		RYLFVESSHT
CFLWYYRVRH		FFNNFTQLIT		VWAYDPESAD		PDELLGNAEE		PSINSIVLST
QMATLGQKPV		IHTVLKRKVY		SSNEKMRRGT		WRIVVPMTKD		DALKEIRGNQ
VTFQDCFIAD		FLILLTFPLL		TIPEIPGYLP		ISSPRGSQLM		ASWDACVVAS
AVLVTDMETF		HTTDSFKSWT		RIRVPPDILS		DDERRSVAHV		ILSRDGIVFL
INGVLYIKSF		RGFIRLGGIV		NLPDGGITGI		SSRKWCWVNY		LLKAKGRRST
FAVWTENEIY		LGSILLKFAR		LVTTTELKNI		LSLSVTATLT		IDRVEYTGHP
LEIAVFLNYC		TVCNVTKKIF		LVIYNEDTKQ		WVSQDFTLDA		PIDSVTMPHF
TFSALPGLLL		WNKHSIYYCY		HNFTFTGILQ		TPAGHGNLSM		LSNDSIIHEV
FIDYYGDILV		KMENNVIFYS		KINTRDAVKL		HLWTNYTTRA		FIFLSTSGQT
YFLYALDDGT		IQIQDYPLHL		EAQSIAFTTK		DKCPYMAFHN		NVAHVFYFLD
KGEALTVWTQ		IVYPENTGLY		VIVESYGPKI		LQESHEISFE		AAFGYCTKTL
TLTFYQNVDY		ERISDYFETQ		DKHTGLVLVQ		FRPSEYSKAC		PIAQKVFQIA
VGCDDKKFIA		IKGFSKKGCH		HHDFSYVIEK		SYLRHQPSKN		LRVRYIWGEY
GCPLRLDFTE		KFQPVVQLFD		DNGYVKDVEA		NFIVWEIHGR		DDYSFNNTMA
QSGCLHEAQT		WKSMIELNKH		LPLEEVWGPE		NYKHCFSYAI		GKPGDLNQPY
EIINSSNGNH		IFWPMGHSGM		YVFRVKILDP		NYSFCNLTAM		FAIETFGLIP
SPSVYLVASF		LFVLMLLFFT		ILVLSYFRYM		RIYRRYIYEP		LHKPQRKRKK
N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1