CASKIN2
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
CASKIN2 (англ. CASK interacting protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 202 амінокислот, а молекулярна маса — 126 783[4].
CASKIN2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CASKIN2, ANKS5B, CASK interacting protein 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 612185 MGI: 2157062 HomoloGene: 32485 GeneCards: CASKIN2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 75.5 – 75.52 Mb | Хр. 11: 115.69 – 115.7 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGREQDLILA | VKNGDVTGVQ | KLVAKVKATK | TKLLGSTKRL | NVNYQDADGF | ||||
SALHHAALGG | SLELIALLLE | AQATVDIKDS | NGMRPLHYAA | WQGRLEPVRL | ||||
LLRASAAVNA | ASLDGQIPLH | LAAQYGHYEV | SEMLLQHQSN | PCLVNKAKKT | ||||
PLDLACEFGR | LKVAQLLLNS | HLCVALLEGE | AKDPCDPNYT | TPLHLAAKNG | ||||
HREVIRQLLR | AGIEINRQTK | TGTALHEAAL | YGKTEVVRLL | LEGGVDVNIR | ||||
NTYNQTALDI | VNQFTTSQAS | REIKQLLREA | SGILKVRALK | DFWNLHDPTA | ||||
LNVRAGDVIT | VLEQHPDGRW | KGHIHESQRG | TDRIGYFPPG | IVEVVSKRVG | ||||
IPAARLPSAP | TPLRPGFSRT | PQPPAEEPPH | PLTYSQLPRV | GLSPDSPAGD | ||||
RNSVGSEGSV | GSIRSAGSGQ | SSEGTNGHGP | GLLIENAQPL | PSAGEDQVLP | ||||
GLHPPSLADN | LSHRPLANCR | SGEQIFTQDV | RPEQLLEGKD | AQAIHNWLSE | ||||
FQLEGYTAHF | LQAGYDVPTI | SRMTPEDLTA | IGVTKPGHRK | KIASEIAQLS | ||||
IAEWLPSYIP | TDLLEWLCAL | GLPQYHKQLV | SSGYDSMGLV | ADLTWEELQE | ||||
IGVNKLGHQK | KLMLGVKRLA | ELRRGLLQGE | ALSEGGRRLA | KGPELMAIEG | ||||
LENGEGPATA | GPRLLTFQGS | ELSPELQAAM | AGGGPEPLPL | PPARSPSQES | ||||
IGARSRGSGH | SQEQPAPQPS | GGDPSPPQER | NLPEGTERPP | KLCSSLPGQG | ||||
PPPYVFMYPQ | GSPSSPAPGP | PPGAPWAFSY | LAGPPATPPD | PPRPKRRSHS | ||||
LSRPGPTEGD | AEGEAEGPVG | STLGSYATLT | RRPGRSALVR | TSPSVTPTPA | ||||
RGTPRSQSFA | LRARRKGPPP | PPPKRLSSVS | GPSPEPPPLD | ESPGPKEGAT | ||||
GPRRRTLSEP | AGPSEPPGPP | APAGPASDTE | EEEPGPEGTP | PSRGSSGEGL | ||||
PFAEEGNLTI | KQRPKPAGPP | PRETPVPPGL | DFNLTESDTV | KRRPKCRERE | ||||
PLQTALLAFG | VASATPGPAA | PLPSPTPGES | PPASSLPQPE | PSSLPAQGVP | ||||
TPLAPSPAMQ | PPVPPCPGPG | LESSAASRWN | GETEPPAAPA | ALLKVPGAGT | ||||
APKPVSVACT | QLAFSGPKLA | PRLGPRPVPP | PRPESTGTVG | PGQAQQRLEQ | ||||
TSSSLAAALR | AAEKSIGTKE | QEGTPSASTK | HILDDISTMF | DALADQLDAM | ||||
LD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tabuchi K., Biederer T., Butz S., Suedhof T.C. (2002). CASK participates in alternative tripartite complexes in which Mint 1 competes for binding with Caskin 1, a novel CASK-binding protein. J. Neurosci. 22: 4264—4273. PMID 12040031
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18200 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WXE0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |