CASKIN1

CASKIN1 (англ. CASK interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 431 амінокислот, а молекулярна маса — 149 814.

CASKIN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3SEI, 3SEN
Ідентифікатори
Символи	CASKIN1, ANKS5A, CASK interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612184 MGI: 2442952 HomoloGene: 25873 GeneCards: CASKIN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57524	268932
Ensembl	ENSG00000167971	ENSMUSG00000033597
UniProt	Q8WXD9	Q6P9K8
RefSeq (мРНК)	NM_020764	NM_027937 NM_001360469
RefSeq (білок)	NP_065815	NP_082213 NP_001347398
Локус (UCSC)	Хр. 16: 2.18 – 2.2 Mb	Хр. 17: 24.71 – 24.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKEQELVQA		VKAEDVGTAQ		RLLQRPRPGK		AKLLGSTKKI		NVNFQDPDGF
SALHHAALNG		NTELISLLLE		AQAAVDIKDN		KGMRPLHYAA		WQGRKEPMKL
VLKAGSAVNI		PSDEGHIPLH		LAAQHGHYDV		SEMLLQHQSN		PCMVDNSGKT
PLDLACEFGR		VGVVQLLLSS		NMCAALLEPR		PGDATDPNGT		SPLHLAAKNG
HIDIIRLLLQ		AGIDINRQTK		SGTALHEAAL		CGKTEVVRLL		LDSGINAHVR
NTYSQTALDI		VHQFTTSQAS		REIKQLLREA		SAALQVRATK		DYCNNYDLTS
LNVKAGDIIT		VLEQHPDGRW		KGCIHDNRTG		NDRVGYFPSS		LGEAIVKRAG
SRAGTEPSLP		QGSSSSGPSA		PPEEIWVLRK		PFAGGDRSGS		ISGMAGGRGS
GGHALHAGSE		GVKLLATVLS		QKSVSESGPG		DSPAKPPEGS		AGVARSQPPV
AHAGQVYGEQ		PPKKLEPASE		GKSSEAVSQW		LTAFQLQLYA		PNFISAGYDL
PTISRMTPED		LTAIGVTKPG		HRKKIAAEIS		GLSIPDWLPE		HKPANLAVWL
SMIGLAQYYK		VLVDNGYENI		DFITDITWED		LQEIGITKLG		HQKKLMLAVR
KLAELQKAEY		AKYEGGPLRR		KAPQSLEVMA		IESPPPPEPT		PADCQSPKMT
TFQDSELSDE		LQAAMTGPAE		VGPTTEKPSS		HLPPTPRATT		RQDSSLGGRA
RHMSSSQELL		GDGPPGPSSP		MSRSQEYLLD		EGPAPGTPPR		EARPGRHGHS
IKRASVPPVP		GKPRQVLPPG		TSHFTPPQTP		TKTRPGSPQA		LGGPHGPAPA
TAKVKPTPQL		LPPTERPMSP		RSLPQSPTHR		GFAYVLPQPV		EGEVGPAAPG
PAPPPVPTAV		PTLCLPPEAD		AEPGRPKKRA		HSLNRYAASD		SEPERDELLV
PAAAGPYATV		QRRVGRSHSV		RAPAGADKNV		NRSQSFAVRP		RKKGPPPPPP
KRSSSALASA		NLADEPVPDA		EPEDGLLGVR		AQCRRASDLA		GSVDTGSAGS
VKSIAAMLEL		SSIGGGGRAA		RRPPEGHPTP		RPASPEPGRV		ATVLASVKHK
EAIGPGGEVV		NRRRTLSGPV		TGLLATARRG		PGESADPGPF		VEDGTGRQRP
RGPSKGEAGV		EGPPLAKVEA		SATLKRRIRA		KQNQQENVKF		ILTESDTVKR
RPKAKEREAG		PEPPPPLSVY		HNGTGTVRRR		PASEQAGPPE		LPPPPPPAEP
PPTDLAHLPP		LPPPEGEARK		PAKPPVSPKP		VLTQPVPKLQ		GSPTPTSKKV
PLPGPGSPEV		KRAHGTPPPV		SPKPPPPPTA		PKPVKAVAGL		PSGSAGPSPA
PSPARQPPAA		LAKPPGTPPS		LGASPAKPPS		PGAPALHVPA		KPPRAAAAAA
AAAAAPPAPP		EGASPGDSAR		QKLEETSACL		AAALQAVEEK		IRQEDAQGPR
DSAAEKSTGS		ILDDIGSMFD		DLADQLDAML		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як метилювання. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Tabuchi K., Biederer T., Butz S., Suedhof T.C. (2002). CASK participates in alternative tripartite complexes in which Mint 1 competes for binding with Caskin 1, a novel CASK-binding protein. J. Neurosci. 22: 4264—4273. PMID 12040031

Див. також

• Хромосома 16