CASC1

CASC1 (англ. Cancer susceptibility 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 716 амінокислот, а молекулярна маса — 83 160.

CASC1
Ідентифікатори
Символи	DNAI7, LAS1, PPP1R54, cancer susceptibility candidate 1, cancer susceptibility 1, cilia and flagella associated protein 94, CASC1, dynein axonemal intermediate chain 7, CFAP94
Зовнішні ІД	OMIM: 616906 MGI: 2444480 HomoloGene: 41242 GeneCards: DNAI7
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55259	320662
Ensembl	ENSG00000118307	ENSMUSG00000043541
UniProt	Q6TDU7	Q6TDU8
RefSeq (мРНК)	NM_001082972 NM_001082973 NM_001204101 NM_001204102 NM_018272 NM_001319977 NM_001319978 NM_001352061 NM_001352062 NM_001352063 NM_001352064 NM_001352065 NM_001352066 NM_001352067 NM_001352068	NM_177222
RefSeq (білок)	NP_001076441 NP_001076442 NP_001191030 NP_001191031 NP_001306906 NP_001306907 NP_060742 NP_001338990 NP_001338991 NP_001338992 NP_001338993 NP_001338994 NP_001338995 NP_001338996 NP_001338997	NP_796196
Локус (UCSC)	Хр. 12: 25.11 – 25.2 Mb	Хр. 6: 145.12 – 145.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSKKKKVT		KAERLKLLQE		EEERRLKEEE		EARLKYEKEE		MERLEIQRIE
KEKWHRLEAK		DLERRNEELE		ELYLLERCFP		EAEKLKQETK		LLSQWKHYIQ
CDGSPDPSVA		QEMNTFISLW		KEKTNETFEE		VIEKSKVVLN		LIEKLKFILL
ETPPCDLQDK		NIIQYQESIL		QLQELLHLKF		GVATEILLKQ		ASTLADLDSG
NMEKVIKDEN		VTLYVWANLK		KNPRHRSVRF		SETQIGFEIP		RILATSDIAV
RLLHTHYDHV		SALHPVSTPS		KEYTSAVTEL		VKDDVKNVEK		AISKEVEEES
KQQERGSHLI		QEEEIKVEEE		QGDIEVKMSS		AEEESEAIKC		EREMKVLSET
VSAAQLLLVE		NSSEKPDFFE		DNVVDLCQFT		TLGGVYHLDI		LELPPQCKPV
KGWMIVEILK		EGLQKYTYPP		ETTEEFETEN		AFPPIEVTLE		VHENVIFFED
PVVVRWDAEG		KHWRTDGISN		VSYKPKERLV		TFSLDTFGPV		TLIQDAHINM
PYQSWELRPL		DVNKVLLTVT		TVFTEIQIQI		KENLCMLSSI		KLKDKKHISI
LEGTWMTPIP		FIIALKEAGL		NIFPTRHSHF		YVIINNKVPL		VEVKAYRQMA
LLSSAFAFGW		SKWNLLCNST		KVVFKVREHL		TEACTENPNW		ALLMFSGDRA
QRLKIKEESE		AFSEALKEET		EFHSTLYHMV		KDFASEEAME		KVRSSNCQFV
NSVCHMLLST		RLLSYS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12