CARNS1

CARNS1
Ідентифікатори
Символи	CARNS1, ATPGD1, carnosine synthase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 613368 MGI: 2147595 HomoloGene: 26439 GeneCards: CARNS1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • ligase activity; • ATPase activity; • ATP binding; • зв'язування з іоном металу; • carnosine synthase activity; • homocarnosine synthase activity; • FMN binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • компонент клітини;
Біологічний процес	• histidine catabolic process; • carnosine biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	57571
	107239
	ENSG00000172508
	ENSMUSG00000075289
	A5YM72
	Q6ZPS2
	NM_001166222; NM_020811; NM_001394577; NM_001394578; NM_001394579
	NM_134148
	NP_001159694; NP_065862
	NP_598909
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CARNS1 (англ. Carnosine synthase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 827 амінокислот, а молекулярна маса — 88 484^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLCLSPAWL	MKVPAPGQPG	EAALLVSKAV	SFHPGGLTFL	DDFVPPRRAT
YFLAGLGLGP	GRGREAAELA	RDLTCPTGAS	AELARLLEDR	LLTRQLLAQQ
GGVAVPATLA	FTYKPPGLLR	GGDASLGLRL	VELSGKEGQE	TLVKEEVEAF
LRSEALGDIL	QVAVKLSGWR	WRGRQAWRLH	PRAELGAVVD	TVLALLEKLE
EEESVLVEAV	YPPAQLPCSD	GPSPGPGLAV	RICAVVCRTQ	GDRPLLSKVV
CGVGRGDRPL	RHHNSLPRTL	EVALAQCGLG	EEAQVAAVRQ	RVKAAAEAAL
AAVLALEAGL	SAEQRGGRRA	HTDFLGVDFA	LTAAGGVLTP	VALELNGGLC
LEACGALEGL	WAAPRLGPAA	DEAVAAPLVE	TMLRRSARCL	MEGKQLLVVG
AGGVSKKFVW	EAARDYGLQL	HLVESDPNHF	ASQLVQTFIH	FDMTEHRRDE
ENARLLAELV	RARGLKLDGC	FSYWDDCLVL	TALLCQELGL	PCSSPAAMRL
AKQKSLTQLH	LLHHHGPPWP	APSLHAVPCC	PLESEADVER	AVHQVPLPGV
MKLEFGAGAV	GVRLVEDAPQ	CHEHFSRITR	DLQGEADHPG	IGLGWGNAML
LMEFVEGTEH	DVDLVLFGGR	LLAAFVSDNG	PTRLPGFTET	AACMPTGLAP
EQEAQMVQAA	FRCCLGCGLL	DGVFNVELKL	TGAGPRLIEI	NPRMGGFYLR
DWILELYGVD	LLLAAVMVAC	GLRPALPTRP	RARGHLVGVM	CLVSQHLQAL
SSTASRETLQ	ALHDRGLLRL	NLLEEALVPG	EYEEPYCSVA	CAGPSPTEAR
LRLLGLCQGL	GIDGPSYPVA	HFLSHFK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном марганцю.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Drozak J., Veiga-da-Cunha M., Vertommen D., Stroobant V., Van Schaftingen E. (2010). Molecular identification of carnosine synthase as ATP-grasp domain-containing protein 1 (ATPGD1). J. Biol. Chem. 285: 9346—9356. PMID 20097752 DOI:10.1074/jbc.M109.095505

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29268 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2016. Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, A5YM72 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29268 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2016. Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, A5YM72 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]