CACTIN

CACTIN (англ. Cactin, spliceosome C complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 758 амінокислот, а молекулярна маса — 88 702.

CACTIN
Ідентифікатори
Символи	CACTIN, C19orf29, NY-REN-24, fSAPc, cactin, spliceosome C complex subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 618536 MGI: 1917562 HomoloGene: 69553 GeneCards: CACTIN
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • Нуклеоплазма • spliceosomal complex • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck • цитоплазма Біологічний процес • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • mRNA splicing, via spliceosome • процес імунної системи • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • mRNA processing • negative regulation of interferon-beta production • negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • multicellular organism development • negative regulation of interleukin-8 production • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • cellular response to interleukin-1 • Сплайсинг РНК • negative regulation of tumor necrosis factor production • вроджений імунітет • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58509	70312
Ensembl	ENSG00000105298	ENSMUSG00000034889
UniProt	Q8WUQ7	Q9CS00
RefSeq (мРНК)	NM_001080543 NM_021231	NM_027381
RefSeq (білок)	NP_001074012 NP_067054	NP_081657
Локус (UCSC)	Хр. 19: 3.61 – 3.63 Mb	Хр. 10: 81.16 – 81.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRDTRSRSR		SAGRRGRRRQ		SQSGSRSRSR		SHGRRNRRRR		EDEGRRRRRR
RSRERRSDSE		EERWQRSGMR		SRSPPRPKWH		SRDGSSQSDS		GEEQSRGQWA
RRRRRARSWS		PSSSASSSAS		PGRSQSPRAA		AAALSQQQSL		QERLRLREER
KQQEELMKAF		ETPEEKRARR		LAKKEAKERK		KREKMGWGEE		YMGYTNTDNP
FGDNNLLGTF		IWNKALEKKG		ISHLEEKELK		ERNKRIQEDN		RLELQKVKQL
RLEREREKAM		REQELEMLQR		EKEAEHFKTW		EEQEDNFHLQ		QAKLRSKIRI
RDGRAKPIDL		LAKYISAEDD		DLAVEMHEPY		TFLNGLTVAD		MEDLLEDIQV
YMELEQGKNA		DFWRDMTTIT		EDEISKLRKL		EASGKGPGER		REGVNASVSS
DVQSVFKGKT		YNQLQVIFQG		IEGKIRAGGP		NLDMGYWESL		LQQLRAHMAR
ARLRERHQDV		LRQKLYKLKQ		EQGVESEPLF		PILKQEPQSP		SRSLEPEDAA
PTPPGPSSEG		GPAEAEVDGA		TPTEGDGDGD		GEGEGEGEAV		LMEEDLIQQS
LDDYDAGRYS		PRLLTAHELP		LDAHVLEPDE		DLQRLQLSRQ		QLQVTGDASE
SAEDIFFRRA		KEGMGQDEAQ		FSVEMPLTGK		AYLWADKYRP		RKPRFFNRVH
TGFEWNKYNQ		THYDFDNPPP		KIVQGYKFNI		FYPDLIDKRS		TPEYFLEACA
DNKDFAILRF		HAGPPYEDIA		FKIVNREWEY		SHRHGFRCQF		ANGIFQLWFH
FKRYRYRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Atzei P., Gargan S., Curran N., Moynagh P.N. (2010). Cactin targets the MHC class III protein IkappaB-like (IkappaBL) and inhibits NF-kappaB and interferon-regulatory factor signaling pathways. J. Biol. Chem. 285: 36804—36817. PMID 20829348 DOI:10.1074/jbc.M110.139113

Див. також

• Хромосома 19