CACFD1

CACFD1 (англ. Calcium channel flower domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 172 амінокислот, а молекулярна маса — 18 470.

CACFD1
Ідентифікатори
Символи	CACFD1, C9orf7, D9S2135, FLOWER, calcium channel flower domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 613104 MGI: 1924317 HomoloGene: 41182 GeneCards: CACFD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • компонент клітини Біологічний процес • vesicle-mediated transport • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11094	381356
Ensembl	ENSG00000160325 ENSG00000280479	ENSMUSG00000015488
UniProt	Q9UGQ2	Q8BG21
RefSeq (мРНК)	NM_001135775 NM_001242369 NM_001242370 NM_017586	NM_001243239 NM_001243240 NM_029862
RefSeq (білок)	NP_001129247 NP_001229298 NP_001229299 NP_060056	NP_001230168 NP_001230169 NP_084138
Локус (UCSC)	Хр. 9: 133.46 – 133.47 Mb	Хр. 2: 26.9 – 26.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSSGGAPGA		SASSAPPAQE		EGMTWWYRWL		CRLSGVLGAV		SCAISGLFNC
ITIHPLNIAA		GVWMIMNAFI		LLLCEAPFCC		QFIEFANTVA		EKVDRLRSWQ
KAVFYCGMAV		VPIVISLTLT		TLLGNAIAFA		TGVLYGLSAL		GKKGDAISYA
RIQQQRQQAD		EEKLAETLEG		EL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9