C9orf84
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
C9orf84 (англ. Chromosome 9 open reading frame 84) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 444 амінокислот, а молекулярна маса — 165 202[4].
C9orf84 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SHOC1, chromosome 9 open reading frame 84, ZIP2H, ZIP2, shortage in chiasmata 1, C9orf84, MZIP2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 618038 MGI: 2140313 HomoloGene: 79783 GeneCards: SHOC1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 111.69 – 111.8 Mb | Хр. 4: 59.04 – 59.14 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTDTSVLDQW | KASFFVEDFL | EKKTITRMVT | QINCEFEEVV | PSSNPDSQIE | ||||
VEEVSLYTHM | DYNEVFTPVS | CLEKCSALQN | QNQDLFIDDK | GILFVSSRKH | ||||
LPTLPTLLSR | LKLFLVKDPL | LDFKGQIFTE | ANFSRECFSL | QETLEAFVKE | ||||
DFCMDKVNFC | QEKLEDTICL | NEPSSFLIEY | EFLIPPSLKP | EIDIPSLSEL | ||||
KELLNPVPEI | INYVDEKEKL | FERDLTNKHG | IEDIGDIKFS | STEILTIQSQ | ||||
SEPEECSKPG | ELEMPLTPLF | LTCQHSSVNS | LRTELQTFPL | SPVCKINLLT | ||||
AEESANEYYM | MWQLERCRSP | LNPFLLTVPR | IQEPHSQYSV | TDLKKIFSVK | ||||
EESLVINLEK | AEWWKQAGLN | LKMMETLEHL | NTYLCHDNLS | SNDTKIEIFL | ||||
PTKVLQLESC | LEHKSHSSPI | ALIDEKSTNA | HLSLPQKSPS | LAKEVPDLCF | ||||
SDDYFSDKGA | AKEEKPKNDQ | EPVNRIIQKK | ENNDHFELDC | TGPSIKSPSS | ||||
SIIKKASFEH | GKKQENDLDL | LSDFIMLRNK | YKTCTSKTEV | TNSDEKHDKE | ||||
ACSLTLQEES | PIVHINKTLE | EINQERGTDS | VIEIQASDSQ | CQAFCLLEAA | ||||
ASPILKNLVS | LCTLPTANWK | FATVIFDQTR | FLLKEQEKVV | SDAVRQGTID | ||||
EREMTFKHAA | LLHLLVTIRD | VLLTCSLDTA | LGYLSKAKDI | YNSILGPYLG | ||||
DIWRQLEIVQ | FIRGKKPETN | YKIQELQCQI | LSWMQSQQQI | KVLIIIRMDS | ||||
DGEKHFLIKI | LNKIEGLTLT | VLHSNERKDF | LESEGVLRGT | SSCVVVHNQY | ||||
IGADFPWSNF | SFVVEYNYVE | DSCWTKHCKE | LNIPYMAFKV | ILPDTVLERS | ||||
TLLDRFGGFL | LEIQIPYVFF | ASEGLLNTPD | ILQLLESNYN | ISLVERGCSE | ||||
SLKLFGSSEC | YVVVTIDEHT | AIILQDLEEL | NYEKASDNII | MRLMALSLQY | ||||
RYCWIILYTK | ETLNSEYLLT | EKTLHHLALI | YAALVSFGLN | SEELDVKLII | ||||
APGVEATALI | IRQIADHSLM | TSKRDPHEWL | DKSWLKVSPS | EEEMYLLDFP | ||||
CINPLVAQLM | LNKGPSLHWI | LLATLCQLQE | LLPEVPEKVL | KHFCSITSLF | ||||
KIGSSSITKS | PQISSPQENR | NQISTLSSQS | SASDLDSVIQ | EHNEYYQYLG | ||||
LGETVQEDKT | TILNDNSSIM | ELKEISSFLP | PVTSYNQTSY | WKDSSCKSNI | ||||
GQNTPFLINI | ESRRPAYNSF | LNHSDSESDV | FSLGLTQMNC | ETIKSPTDTQ | ||||
KRVSVVPRFI | NSQKRRTHEA | KGFINKDVSD | PIFSLEGTQS | PLHWNFKKNI | ||||
WEQENHPFNL | QYGAQQTACN | KLYSQKGNLF | TDQQKCLSDE | SEGLTCESSK | ||||
DETFWRELPS | VPSLDLFRAS | DSNANQKEFN | SLYFYQRAGK | SLGQKRHHES | ||||
SFNSGDKESL | TGFMCSQLPQ | FKKRRLAYEK | VPGRVDGQTR | LRFF |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26535 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5VXU9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |