C6orf106

C6orf106 (англ. Chromosome 6 open reading frame 106) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 298 амінокислот, а молекулярна маса — 32 872.

C6orf106
Ідентифікатори
Символи	ILRUN, FP852, dJ391O22.4, chromosome 6 open reading frame 106, C6orf106, inflammation and lipid regulator with UBA-like and NBR1-like domains
Зовнішні ІД	OMIM: 612217 MGI: 106281 HomoloGene: 32575 GeneCards: ILRUN
Онтологія гена Молекулярна функція • ubiquitin binding • молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • autophagosome • phagophore assembly site • компонент клітини • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • macroautophagy • GO:0022610 життєдіяльність • negative regulation of type I interferon production • negative regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of DNA binding • negative regulation of defense response to virus • negative regulation of protein localization to nucleus • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64771	224647
Ensembl	ENSG00000196821	ENSMUSG00000056692
UniProt	Q9H6K1	Q3TT38
RefSeq (мРНК)	NM_022758 NM_024294	NM_001033279 NM_001044719 NM_001271511
RefSeq (білок)	NP_073595 NP_077270	NP_001028451 NP_001038184 NP_001258440
Локус (UCSC)	Хр. 6: 34.59 – 34.7 Mb	Хр. 17: 27.97 – 28.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGMDVDLDP		ELMQKFSCLG		TTDKDVLISE		FQRLLGFQLN		PAGCAFFLDM
TNWNLQAAIG		AYYDFESPNI		SVPSMSFVED		VTIGEGESIP		PDTQFVKTWR
IQNSGAEAWP		PGVCLKYVGG		DQFGHVNMVM		VRSLEPQEIA		DVSVQMCSPS
RAGMYQGQWR		MCTATGLYYG		DVIWVILSVE		VGGLLGVTQQ		LSSFETEFNT
QPHRKVEGNF		NPFASPQKNR		QSDENNLKDP		GGSEFDSISK		NTWAPAPDTW
APAPDQTEQD		QNRLSQNSVN		LSPSSHANNL		SVVTYSKGLH		GPYPFGQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6