C17orf80

C17orf80 (англ. Chromosome 17 open reading frame 80) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 609 амінокислот, а молекулярна маса — 67 315.

C17orf80
Ідентифікатори
Символи	C17orf80, HLC-8, MIG3, SPEP1, chromosome 17 open reading frame 80
Зовнішні ІД	MGI: 106356 HomoloGene: 9928 GeneCards: C17orf80
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • екзосома Біологічний процес • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55028	276852
Ensembl	ENSG00000141219	ENSMUSG00000041623
UniProt	Q9BSJ5	Q6PIX9
RefSeq (мРНК)	NM_001100621 NM_001100622 NM_001288770 NM_001288771 NM_017941 NM_001351264 NM_001351265 NM_001386978 NM_001386979 NM_001386983 NM_001386986	NM_177777 NM_001361593
RefSeq (білок)	NP_001094091 NP_001094092 NP_001275699 NP_001275700 NP_060411 NP_001338193 NP_001338194	NP_808445 NP_001348522
Локус (UCSC)	Хр. 17: 73.23 – 73.25 Mb	Хр. 11: 113.58 – 113.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDNPPRMEV		CPYCKKPFKR		LKSHLPYCKM		IGPTIPTDQK		VYQSKPATLP
RAKKMKGPIK		DLIKAKGKEL		ETENEERNSK		LVVDKPEQTV		KTFPLPAVGL
ERAATTKADK		DIKNPIQPSF		KMLKNTKPMT		TFQEETKAQF		YASEKTSPKR
ELAKDLPKSG		ESRCNPSEAG		ASLLVGSIEP		SLSNQDRKYS		STLPNDVQTT
SGDLKLDKID		PQRQELLVKL		LDVPTGDCHI		SPKNVSDGVK		RVRTLLSNER
DSKGRDHLSG		VPTDVTVTET		PEKNTESLIL		SLKMSSLGKI		QVMEKQEKGL
TLGVETCGSK		GNAEKSMSAT		EKQERTVMSH		GCENFNTRDS		VTGKESQGER
PHLSLFIPRE		TTYQFHSVSQ		SSSQSLASLA		TTFLQEKKAE		AQNHHCVPDV
KALMESPEGQ		LSLEPKSDSQ		FQASHTGCQS		PLCSAQRHTP		QSPFTNHAAA
AGRKTLRSCM		GLEWFPELYP		GYLGLGVLPG		KPQCWNAMTQ		KPQLISPQGE
RLSQVSLLER		SSTHIRSLEP		PAGLTTSNFS		LMRLLGAVQK		GWIRCNTTIR
KSGFGGITML		FTGYFVLCCS		WSFRRLKKLC		RPLPWKSTVP		PCIGVAKTTG
DCRSKTCLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17