BRPF3

BRPF3 (англ. Bromodomain and PHD finger containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 205 амінокислот, а молекулярна маса — 135 745.

BRPF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3PFS
Ідентифікатори
Символи	BRPF3, bromodomain and PHD finger containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 616856 MGI: 2146836 HomoloGene: 16092 GeneCards: BRPF3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • extracellular region • гіалоплазма • MOZ/MORF histone acetyltransferase complex Біологічний процес • platelet degranulation • histone H3 acetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27154	268936
Ensembl	ENSG00000096070	ENSMUSG00000063952
UniProt	Q9ULD4	B2KF05
RefSeq (мРНК)	NM_015695	NM_001081315 NM_199061
RefSeq (білок)	NP_056510	NP_001074784
Локус (UCSC)	Хр. 6: 36.2 – 36.23 Mb	Хр. 17: 29.02 – 29.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRKPRRKSRQ		NAEGRRSPSP		YSLKCSPTRE		TLTYAQAQRI		VEVDIDGRLH
RISIYDPLKI		ITEDELTAQD		ITECNSNKEN		SEQPQFPGKS		KKPSSKGKKK
ESCSKHASGT		SFHLPQPSFR		MVDSGIQPEA		PPLPAAYYRY		IEKPPEDLDA
EVEYDMDEED		LAWLDMVNEK		RRVDGHSLVS		ADTFELLVDR		LEKESYLESR
SSGAQQSLID		EDAFCCVCLD		DECHNSNVIL		FCDICNLAVH		QECYGVPYIP
EGQWLCRCCL		QSPSRPVDCI		LCPNKGGAFK		QTSDGHWAHV		VCAIWIPEVC
FANTVFLEPI		EGIDNIPPAR		WKLTCYICKQ		KGLGAAIQCH		KVNCYTAFHV
TCAQRAGLFM		KIEPMRETSL		NGTIFTVRKT		AYCEAHSPPG		AATARRKGDS
PRSISETGDE		EGLKEGDGEE		EEEEEVEEEE		QEAQGGVSGS		LKGVPKKSKM
SLKQKIKKEP		EEAGQDTPST		LPMLAVPQIP		SYRLNKICSG		LSFQRKNQFM
QRLHNYWLLK		RQARNGVPLI		RRLHSHLQSQ		RNAEQREQDE		KTSAVKEELK
YWQKLRHDLE		RARLLIELIR		KREKLKREQV		KVQQAAMELE		LMPFNVLLRT
TLDLLQEKDP		AHIFAEPVNL		SEVPDYLEFI		SKPMDFSTMR		RKLESHLYRT
LEEFEEDFNL		IVTNCMKYNA		KDTIFHRAAV		RLRDLGGAIL		RHARRQAENI
GYDPERGTHL		PESPKLEDFY		RFSWEDVDNI		LIPENRAHLS		PEVQLKELLE
KLDLVSAMRS		SGARTRRVRL		LRREINALRQ		KLAQPPPPQP		PSLNKTVSNG
ELPAGPQGDA		AVLEQALQEE		PEDDGDRDDS		KLPPPPTLEP		TGPAPSLSEQ
ESPPEPPTLK		PINDSKPPSR		FLKPRKVEED		ELLEKSPLQL		GNEPLQRLLS
DNGINRLSLM		APDTPAGTPL		SGVGRRTSVL		FKKAKNGVKL		QRSPDRVLEN
GEDHGVAGSP		ASPASIEEER		HSRKRPRSRS		CSESEGERSP		QQEEETGMTN
GFGKHTESGS		DSECSLGLSG		GLAFEACSGL		TPPKRSRGKP		ALSRVPFLEG
VNGDSDYNGS		GRSLLLPFED		RGDLEPLELV		WAKCRGYPSY		PALIIDPKMP
REGLLHNGVP		IPVPPLDVLK		LGEQKQAEAG		EKLFLVLFFD		NKRTWQWLPR
DKVLPLGVED		TVDKLKMLEG		RKTSIRKSVQ		VAYDRAMIHL		SRVRGPHSFV
TSSYL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6