BRD7

BRD7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2I7K
Ідентифікатори
Символи	BRD7, BP75, CELTIX1, NAG4, bromodomain containing 7, SMARCI1
Зовнішні ІД	OMIM: 618489 MGI: 1349766 HomoloGene: 8085 GeneCards: BRD7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0031493 histone binding; • p53 binding; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • lysine-acetylated histone binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • клітинний цикл; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • Wnt signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of histone acetylation; • regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	29117
	26992
	ENSG00000166164
	ENSMUSG00000031660
	Q9NPI1
	O88665
	NM_001173984; NM_013263
	NM_012047
	NP_001167455; NP_037395
NP_036177; NP_001363942; NP_001363943; NP_001363944; NP_001363945;
	NP_001363946
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BRD7 (англ. Bromodomain containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 651 амінокислот, а молекулярна маса — 74 139^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKKHKKHKS	DKHLYEEYVE	KPLKLVLKVG	GNEVTELSTG	SSGHDSSLFE
DKNDHDKHKD	RKRKKRKKGE	KQIPGEEKGR	KRRRVKEDKK	KRDRDRVENE
AEKDLQCHAP	VRLDLPPEKP	LTSSLAKQEE	VEQTPLQEAL	NQLMRQLQRK
DPSAFFSFPV	TDFIAPGYSM	IIKHPMDFST	MKEKIKNNDY	QSIEELKDNF
KLMCTNAMIY	NKPETIYYKA	AKKLLHSGMK	ILSQERIQSL	KQSIDFMADL
QKTRKQKDGT	DTSQSGEDGG	CWQREREDSG	DAEAHAFKSP	SKENKKKDKD
MLEDKFKSNN	LEREQEQLDR	IVKESGGKLT	RRLVNSQCEF	ERRKPDGTTT
LGLLHPVDPI	VGEPGYCPVR	LGMTTGRLQS	GVNTLQGFKE	DKRNKVTPVL
YLNYGPYSSY	APHYDSTFAN	ISKDDSDLIY	STYGEDSDLP	SDFSIHEFLA
TCQDYPYVMA	DSLLDVLTKG	GHSRTLQEME	MSLPEDEGHT	RTLDTAKEME
ITEVEPPGRL	DSSTQDRLIA	LKAVTNFGVP	VEVFDSEEAE	IFQKKLDETT
RLLRELQEAQ	NERLSTRPPP	NMICLLGPSY	REMHLAEQVT	NNLKELAQQV
TPGDIVSTYG	VRKAMGISIP	SPVMENNFVD	LTEDTEEPKK	TDVAECGPGG
S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, сигнальний шлях Wnt, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Staal A., Enserink J.M., Stein J.L., Stein G.S., van Wijnen A.J. (2000). Molecular characterization of celtix-1, a bromodomain protein interacting with the transcription factor interferon regulatory factor 2. J. Cell. Physiol. 185: 269—279. PMID 11025449 DOI:10.1002/1097-4652(200011)185:2<269::AID-JCP12>3.0.CO;2-L
Kzhyshkowska J.G., Rusch A., Wolf H., Dobner T. (2003). Regulation of transcription by the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein E1B-AP5 is mediated by complex formation with the novel bromodomain-containing protein BRD7. Biochem. J. 371: 385—393. PMID 12489984 DOI:10.1042/BJ20021281
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Burrows A.E., Smogorzewska A., Elledge S.J. (2010). Polybromo-associated BRG1-associated factor components BRD7 and BAF180 are critical regulators of p53 required for induction of replicative senescence. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 14280—14285. PMID 20660729 DOI:10.1073/pnas.1009559107

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14310 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NPI1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14310 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9NPI1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]