BPIFA1

BPIFA1 (англ. BPI fold containing family A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 256 амінокислот, а молекулярна маса — 26 713.

BPIFA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4KEG, 4KGH, 4KGO, 4N4X, 5I7K, 5I7J, 5I7L
Ідентифікатори
Символи	BPIFA1, LUNX, NASG, PLUNC, SPLUNC1, SPURT, bA49G10.5, BPI fold containing family A member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607412 MGI: 1338036 HomoloGene: 7895 GeneCards: BPIFA1
Онтологія гена Молекулярна функція • lipid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of single-species biofilm formation in or on host organism • multicellular organismal water homeostasis • defense response to bacterium • regulation of sodium ion transmembrane transport • antibacterial humoral response • процес імунної системи • вроджений імунітет • antimicrobial humoral response • regulation of liquid surface tension • immune response in nasopharyngeal-associated lymphoid tissue • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51297	18843
Ensembl	ENSG00000198183	ENSMUSG00000027483
UniProt	Q9NP55	P97361
RefSeq (мРНК)	NM_001243193 NM_016583 NM_130852	NM_011126
RefSeq (білок)	NP_001230122 NP_057667 NP_570913	NP_035256
Локус (UCSC)	Хр. 20: 33.24 – 33.24 Mb	Хр. 2: 153.98 – 153.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFQTGGLIVF		YGLLAQTMAQ		FGGLPVPLDQ		TLPLNVNPAL		PLSPTGLAGS
LTNALSNGLL		SGGLLGILEN		LPLLDILKPG		GGTSGGLLGG		LLGKVTSVIP
GLNNIIDIKV		TDPQLLELGL		VQSPDGHRLY		VTIPLGIKLQ		VNTPLVGASL
LRLAVKLDIT		AEILAVRDKQ		ERIHLVLGDC		THSPGSLQIS		LLDGLGPLPI
QGLLDSLTGI		LNKVLPELVQ		GNVCPLVNEV		LRGLDITLVH		DIVNMLIHGL
QFVIKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Bingle C.D., Bingle L. (2000). Characterization of the human plunc gene, a gene product with an upper airways and nasopharyngeal restricted expression pattern. Biochim. Biophys. Acta. 1493: 363—367. PMID 11018263 DOI:10.1016/S0167-4781(00)00196-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lindahl M., Stahlbom B., Tagesson C. (2001). Identification of a new potential airway irritation marker, palate lung nasal epithelial clone protein, in human nasal lavage fluid with two-dimensional electrophoresis and matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight. Electrophoresis. 22: 1795—1800. PMID 11425234 DOI:10.1002/1522-2683(200105)22:9<1795::AID-ELPS1795>3.0.CO;2-J
• Ghafouri B., Kihlstroem E., Tagesson C., Lindahl M. (2004). PLUNC in human nasal lavage fluid: multiple isoforms that bind to lipopolysaccharide. Biochim. Biophys. Acta. 1699: 57—63. PMID 15158712 DOI:10.1016/j.bbapap.2004.01.001
• Sayeed S., Nistico L., St Croix C., Di Y.P. (2013). Multifunctional role of human SPLUNC1 in Pseudomonas aeruginosa infection. Infect. Immun. 81: 285—291. PMID 23132494 DOI:10.1128/IAI.00500-12

Див. також

• Хромосома 20