BOP1

BOP1 (англ. Block of proliferation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 746 амінокислот, а молекулярна маса — 83 630.

BOP1
Ідентифікатори
Символи	BOP1, block of proliferation 1, BOP1 ribosomal biogenesis factor
Зовнішні ІД	OMIM: 610596 MGI: 1334460 HomoloGene: 6612 GeneCards: BOP1
Онтологія гена Молекулярна функція • ribonucleoprotein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • PeBoW complex • нуклеоплазма • preribosome, large subunit precursor • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • ribosomal large subunit biogenesis • cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • проліферація • ribosome biogenesis • regulation of cell cycle • rRNA processing • maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosomal large subunit assembly • regulation of signal transduction by p53 class mediator • maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23246	12181
Ensembl	ENSG00000261236 ENSG00000285301	ENSMUSG00000022557
UniProt	Q14137	P97452
RefSeq (мРНК)	NM_015201	NM_013481
RefSeq (білок)	NP_056016	NP_038509
Локус (UCSC)	Хр. 8: 144.26 – 144.29 Mb	Хр. 15: 76.34 – 76.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGSRGAGRT		AAPSVRPEKR		RSEPELEPEP		EPEPPLLCTS		PLSHSTGSDS
GVSDSEESVF		SGLEDSGSDS		SEDDDEGDEE		GEDGALDDEG		HSGIKKTTEE
QVQASTPCPR		TEMASARIGD		EYAEDSSDEE		DIRNTVGNVP		LEWYDDFPHV
GYDLDGRRIY		KPLRTRDELD		QFLDKMDDPD		YWRTVQDPMT		GRDLRLTDEQ
VALVRRLQSG		QFGDVGFNPY		EPAVDFFSGD		VMIHPVTNRP		ADKRSFIPSL
VEKEKVSRMV		HAIKMGWIQP		RRPRDPTPSF		YDLWAQEDPN		AVLGRHKMHV
PAPKLALPGH		AESYNPPPEY		LLSEEERLAW		EQQEPGERKL		SFLPRKFPSL
RAVPAYGRFI		QERFERCLDL		YLCPRQRKMR		VNVDPEDLIP		KLPRPRDLQP
FPTCQALVYR		GHSDLVRCLS		VSPGGQWLVS		GSDDGSLRLW		EVATARCVRT
VPVGGVVKSV		AWNPSPAVCL		VAAAVEDSVL		LLNPALGDRL		VAGSTDQLLS
AFVPPEEPPL		QPARWLEASE		EERQVGLRLR		ICHGKPVTQV		TWHGRGDYLA
VVLATQGHTQ		VLIHQLSRRR		SQSPFRRSHG		QVQRVAFHPA		RPFLLVASQR
SVRLYHLLRQ		ELTKKLMPNC		KWVSSLAVHP		AGDNVICGSY		DSKLVWFDLD
LSTKPYRMLR		HHKKALRAVA		FHPRYPLFAS		GSDDGSVIVC		HGMVYNDLLQ
NPLLVPVKVL		KGHVLTRDLG		VLDVIFHPTQ		PWVFSSGADG		TVRLFT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep. 5: 237—247. PMID 24120868 DOI:10.1016/j.celrep.2013.08.049

Див. також

• Хромосома 8