Вікіпедія

BDP1

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

BDP1 (англ. B double prime 1, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 624 амінокислот, а молекулярна маса — 293 885[5].

BDP1
Ідентифікатори
Символи BDP1, HSA238520, TAF3B1, TFC5, TFIIIB150, TFIIIB90, TFNR, B double prime 1, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor IIIB, DFNB112, TFIIIB
Зовнішні ІД OMIM: 607012 MGI: 1347077 HomoloGene: 34582 GeneCards: BDP1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
55814
544971
Ensembl
ENSG00000274803
ENSG00000273873
ENSG00000145734
ENSMUSG00000049658
UniProt
A6H8Y1
H7C5U4
Q571C7
RefSeq (мРНК)
NM_018429
NM_001081061
RefSeq (білок)
NP_060899
NP_001074530
Локус (UCSC) Хр. 5: 71.46 – 71.57 Mb Хр. 13: 100.02 – 100.1 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MFRRARLSVKPNVRPGVGARGSTASNPQRGRESPRPPDPATDSASKPAEP
TDVPTVDFGGAEPQEKAPRSSTEKTGGDNDVEESSRSSSTVSQRRKRISS
TSSLVKSSVSVPSESHPLSTINQEAPQPTATSTKEKQPCSDRYRIYKAQK
LREMLKEELRKEKKQWKNKYAINESQRPPDRSKMTMRDFIYYLPDNNPMT
SSLEQEKKTEKPSTPVQTREQEGKSTPNAEDNEMEEETDDGPLLVPRVKV
AEDGSIILDEESLTVEVLRTKGPCVVEENDPIFERGSTTTYSSFRKNYYS
KPWSNKETDMFFLAISMVGTDFSMIGQLFPHRARIEIKNKFKREEKTNGW
RIDKAFQEKRPFDFDFFAHLLQKVLAEEEKRKQKSVKNHSLKEKKSTKPR
KNVKVKKVACEGVNNDPDESMSSRISDTERSQKDAQTVEEESLTLSREDA
EQVALEVDLNQKKRRRKKQDGANELGVNNLLENATVQAGPSKGEKHKNKC
QAIRPELKEGECSKEQMLSCTQNIDGIVGFASTEKVEKRTDPILSLSNQQ
DATSVATESSESSTSDLPSFEVGIRALCEVNNAEGSCIEERNVDLKNNSL
EIDQTENVKPMLRGRFQRPKPNLSRAGKKSVLSQGKTESESKNSHSKTSV
EKNHVEKDKMNTLDILRMETTERENPEAETVSVLGEKNCLQEGSQLKALR
PVQVRGRLQKPKPNAGKAAERKEILISQEEIGANVEKNENESCADRDTPQ
HMEDQSRKDFEEEDVILQPEKNDSFQNVQPDEPKVLNECLSVQENNKANK
LNQVPILRTRFQKPKPNIGRGTGRREISSKEEVLEKILVSGEMAAALRET
VRLDTSPKEMVPAEINTKEMQSDLKETGRRAISPREKILDVIDDTIEMET
GLKAMGREICLREKTPEVIDATEEIDKDLEEAGRREISPQKNGPEEVKPL
GEVETDLKATGNESSPREKTPEVTDATEEIDKNLEETGRRKISPRENGPE
EVKPVDEMETDLNATGRESSPREKTPEVIDATEEIDLEETEREVSPQENG
LEEVKPLGEMETDLKATGRDSFPRGKTPEVIDAIEEIEIDLEETEREISP
QENGLEEVKPLGEMQTDLKATGREISPREKTPEVIDATEEIDKDLEETGR
REISPEENGPEEVKPVDEMETDLKTTGREGSSREKTREVIDAAEVIETDL
EETEREISPQENGPEEVKPVGKMETDLKEIREEISQREKVLAEFSAIREK
EIDLKETGKRDIPIMEKVSGKMAVVEEMEADLKETGKENFRERGSEEICV
TEEKVAELKQTGKTDISPRENELEETSTSRQTDTHLMQSGSNDFSAVPSL
DIQNISSEVLSMMHTPVEEKRNSEKEVSSHFSHFKISSQTHESDKTEVQG
IQSPDVPEQFSDINLSKSLPQEQKPLEIKPAPFVRSRFKRPKPNLARAAL
KRETTESEKYIYEKKSETKKMETIVMQENNEQTDTLPSQHDEASLMISRE
KDTLGHRNEEAVILPCTQTERNLSPSNSCEPKEESQSAPVQKNDSVVSVG
TNNVNTFQQEMKESVIQTARQVRGRLQRPRPNIRKTGQRQIVDKGEAKGI
IKEGRTILPKDETEKKVLTVSNSQIETEIEVPSSAVPEHRMYENQSQVVL
VENLHVNKTNETIRHENKPYVPSSAQMTRRKFQKAKPNLGRAHSKKEEPV
LEKVTTDQSKEGKPEDHLLQKGASNTQLLLKEKAELLTSLEVSARKDCVG
SKESALAKIDAELEEVGPSRRVGEETVGDNSPSSVVEEQYLNKLTSCPQP
LNETSYSKIALDGKTTISSTSEYERNRGERRSHKKFKPNVTRGRGSKRVR
GKTSKKEPRASKAMLVTLRASQEEDDDADDFESDYEEESYHLAPEEVNKA
PVFVPVGLRSPEPVSAQIEETMEELEITVNVPDVGCIAVVEHELPNTDVT
TEEMKQEENLSVPFEMTTSEHIQDEPGTNDGSTEAAITLLTMGDLVLQSE
ISSEQGDVGVCIIPHVHSKDKSHIPSSLDNVNHKIVHECQELSSPVITTS
PASFEENKIVLEEQSSREEISLMEKVKENATPTRNTISKVTSNLRIRSRL
AKPKPNLEKTLGTNRLDDYQEVSSLCVTKGAEMETQRETEKNASKATELE
NKNLGPVTTAENKDQSKLACVHGIKGTSISSEVNLTERNENQEESSQEVH
MLSVAPVASSETGPCTLGLDRGLGENSVEEPQIKDSKGDSVLTLPVPEYT
PTSIPEVQQENIINPQDLTVNLVANVPQDGEDEQAFILTLVEIPANAVEE
FTDATAQFMPNPLLPAPILVKSVNTEERGDMSICLPATSVGQDAMGLSIS
GRDNSKKPPDNLDLVSRKRFQCRLDKNDHIPPAKKRSLTLRDDCQEYTTE
VHSKELTNVFEETGESHKGQDIFLTSGSTLTTPEPQRQQVEAAFQSRGSR
SPDACMDKNVPQLPQDEMIVSDKEERTDAAPKSQQMDSRTSSSKASLSRP
GRRPLGFLSLICSKNSLESDEPMQVHSKKRLKPLIPGLRKKLKRSNPFNE
SQEKNRESSDLLPSPSVITTQSENISSSATQVSCDQPLLKEGYKSAQKRA
PQGEATTVSEYFFNDIFIEVDETE

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

ред.
  • Schramm L., Pendergrast P.S., Sun Y., Hernandez N. (2000). Different human TFIIIB activities direct RNA polymerase III transcription from TATA-containing and TATA-less promoters. Genes Dev. 14: 2650—2663. PMID 11040218 DOI:10.1101/gad.836400
  • Kelter A.R., Herchenbach J., Wirth B. (2000). The transcription factor-like nuclear regulator (TFNR) contains a novel 55-amino-acid motif repeated nine times and maps closely to SMN1. Genomics. 70: 315—326. PMID 11161782 DOI:10.1006/geno.2000.6396
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Teichmann M., Wang Z., Roeder R.G. (2000). A stable complex of a novel transcription factor IIB- related factor, human TFIIIB50, and associated proteins mediate selective transcription by RNA polymerase III of genes with upstream promoter elements. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 14200—14205. PMID 11121026 DOI:10.1073/pnas.97.26.14200
  • Fairley J.A., Scott P.H., White R.J. (2003). TFIIIB is phosphorylated, disrupted and selectively released from tRNA promoters during mitosis in vivo. EMBO J. 22: 5841—5850. PMID 14592981 DOI:10.1093/emboj/cdg544
  • Hu P., Samudre K., Wu S., Sun Y., Hernandez N. (2004). CK2 phosphorylation of Bdp1 executes cell cycle-specific RNA polymerase III transcription repression. Mol. Cell. 16: 81—92. PMID 15469824 DOI:10.1016/j.molcel.2004.09.008

Примітки

ред.
  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з BDP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13652 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, A6H8Y1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

ред.
  Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.
Отримано з https://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=BDP1&oldid=35350905